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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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还重名啊

铜虫 (小有名气)

[求助] 知道了某一个物种的全基因组怎么找到某个基因的启动子? 已有5人参与

知道了某一个物种的全基因组后,怎么找到某个基因的启动子?已经有了这个基因的CDS。用什么软件或者方法?刚接触该领域,请各前辈不佞指教
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2015-02-13 12:54:42
那么多ATG在序列里,你怎么知道哪个是对的,也不知道你的那个ATG读码框对不对。。。一般都有数据库预测的CDS,CDS之前的1k-2k都可以作为启动子。
7楼2015-01-28 02:11:57
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查看全部 9 个回答

digitalbio

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
还重名啊(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-24 20:50:42
ATG上游500-1000bp可以试试。大体就是两个基因间的片段。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-01-24 06:38:16
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
区段上游2-3kb,可以用软件也测结构域
3楼2015-01-24 09:07:36
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还重名啊

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-24 09:07:36
区段上游2-3kb,可以用软件也测结构域

怎么在基因组里找一个基因的上游呢??
4楼2015-01-24 12:27:49
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