【答案】应助回帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

蛋白表达的序列为什么比基因序列短已经有6人回复
怎样判断两个靶点的同源性已经有3人回复
在NCBI里搜索到a基因多条序列，如何确定该基因的序列？已经有9人回复
如何查找一段基因序列的启动子？已经有3人回复
查找保守序列的问题已经有5人回复
关于克隆植物基因启动子序列？已经有4人回复
如何找到水稻一段序列的上下游序列？已经有5人回复
怎么使用NCBI克隆基因？已经有7人回复
已知一段启动子序列，如何查找它可能在哪些基因中起作用已经有4人回复
如何获取基因家族所有成员的cDNA序列已经有8人回复
利用NCBI,查询乳酸乳球菌的乳糖操纵子中的Lac A 基因启动子序列已经有8人回复
求助查找基因序列已经有5人回复
NCBI序列一定正确吗已经有15人回复
在NCBI中查到一个基因怎么看操纵子和启动子区域？已经有20人回复
如何找到蛋白所结合的DNA序列已经有3人回复
请问学生物的：DNA序列d(ACCCC)和d(CCCCA)在化学结构和性质上上有很大的的差别么？已经有4人回复
已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列，如何设计PVR的上下游引物呢？已经有7人回复
【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。已经有17人回复
【求助/交流】如何在ncbi上找到我想要的目的基因已经有5人回复

1楼2013-10-15 22:49:37

回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

颜露露

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 26.5
帖子: 31
在线: 3.4小时
虫号: 3090425
注册: 2014-03-26
专业: 细胞周期与调控

【答案】应助回帖

引用回帖:

6楼: Originally posted by zsp88 at 2014-03-11 17:38:07
可是genebank中好多序列的CDs区前只有60bp，那么其他的部分怎么找啊？...

你别搜索nucleotide，要搜索chromesome，去全基因组序列里，找到这个基因的位置，然后，复制它上游大概3kb的序列，里面会包含启动子元件，你用预测软件找一下，或者传统方法，逐渐剪短做启动子系列载体来寻找。如果是研究功能，研究特定蛋白作用位点，还是建议预测一下有针对性地设计。

赞一下(3人)

8楼2014-03-26 17:04:15

紫宸成政

木虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 2057.4
帖子: 21
在线: 33.2小时
虫号: 2064834
注册: 2012-10-16
性别: GG
专业: 动物遗传学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-16 09:10:33
冷眼倦天涯: 金币+2 2014-01-15 10:54:53

可以先找到该基因然后在注释中找到CDS区从CDS区向上推2500到4000bp 具体推多少就要看文章了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

赞一下(2人)

2楼2013-10-16 06:25:40

tom8559

新虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 780.3
帖子: 7
在线: 4.6小时
虫号: 2678939
注册: 2013-09-25
专业: 微生物生理与生物化学

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
冷眼倦天涯: 金币+1, ★有帮助 2014-01-15 10:54:39

这个网站可能会有帮助，当真正找到启动子序列很难，一般都是预估多少bp吧。http://wenku.baidu.com/view/fd76162e0066f5335a8121b5.html

赞一下(1人)

4楼2013-10-17 11:42:20

jihao1986

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 6
帖子: 8
在线: 3.3小时
虫号: 4018764
注册: 2015-08-12
专业: 生物信息学

引用回帖:

8楼: Originally posted by 颜露露 at 2014-03-26 17:04:15
你别搜索nucleotide，要搜索chromesome，去全基因组序列里，找到这个基因的位置，然后，复制它上游大概3kb的序列，里面会包含启动子元件，你用预测软件找一下，或者传统方法，逐渐剪短做启动子系列载体来寻找。如果 ...

楼上你好，我想问一下，在全基因组序列里面相邻的基因A和基因B夹着的区域是不是就包含着基因B的启动子序列？

赞一下(1人)

9楼2015-11-16 21:49:42

普通回帖

ck8148

金虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 550.3
散金: 10
红花: 1
帖子: 40
在线: 80.1小时
虫号: 1218259
注册: 2011-03-02
性别: GG
专业: 临床分子生物学检验

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
冷眼倦天涯: 金币+1 2014-01-15 10:55:26

在TAIR网址上面找拟南芥的，很全，但只是相似序列

3楼2013-10-17 11:31:08

冷眼倦天涯

金虫 (小有名气)

5楼2014-01-15 10:55:43

zsp88

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 241.6
帖子: 40
在线: 11小时
虫号: 1930991
注册: 2012-08-09
专业: 植物生理与生化

引用回帖:

2楼: Originally posted by 紫宸成政 at 2013-10-16 06:25:40
可以先找到该基因然后在注释中找到CDS区从CDS区向上推2500到4000bp 具体推多少就要看文章了

可是genebank中好多序列的CDs区前只有60bp，那么其他的部分怎么找啊？

6楼2014-03-11 17:38:07

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 363 (硕士)
金币: 7752.3
散金: 15
红花: 9
帖子: 751
在线: 188.2小时
虫号: 819723
注册: 2009-07-31
性别: GG
专业: 植物遗传学

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-12 10:19:19

基因的启动子位于基因前2kb区域左右，核心区域也就几百bp，建议把基因前的序列分析一下一般会有重复序列，从重复序列后端到ATG前端克隆启动子比较完全。

hehe

7楼2014-03-11 20:16:31

叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 89.3
帖子: 16
在线: 39.5小时
虫号: 902493
注册: 2009-11-13
专业: 免疫生物学

引用回帖:

9楼: Originally posted by jihao1986 at 2015-11-16 21:49:42
楼上你好，我想问一下，在全基因组序列里面相邻的基因A和基因B夹着的区域是不是就包含着基因B的启动子序列？...

楼主您好，我有已知的细菌基因序列，想分析一个基因的结构，比如启动子区域，请问应该用什么预测软件呀？谢谢指教

10楼2020-10-15 13:05:53