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王贤卓

金虫 (正式写手)

[求助] 利用NCBI,查询乳酸乳球菌的乳糖操纵子中的Lac A 基因启动子序列 已有1人参与

谁会查该启动子序列，或者只要会查询启动子序列的大神，请求指教。。。金币不是问题

[ 来自科研家族 生物医药家族 ]
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1楼 2012-11-23 17:39:30
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王贤卓

金虫 (正式写手)
谁会，求大神啊。。。
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2楼2012-11-23 17:40:06
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王贤卓

金虫 (正式写手)
3楼2012-11-25 14:38:09
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王贤卓

金虫 (正式写手)
求助啊。。。
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4楼2012-11-26 14:20:48
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czdaeq

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
王贤卓: 金币+5, ★★★很有帮助, 让知道另外一种查启动序列的方法 2012-11-27 09:19:08
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助 2012-11-27 10:58:25
楼主有序列么？
授人以鱼不如授人以渔：http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html
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5楼2012-11-26 21:23:49
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王贤卓

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by czdaeq at 2012-11-26 21:23:49
楼主有序列么？
授人以鱼不如授人以渔：http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html

你那个网站，我试了下。但结果不是我想要的！！！！我想要的结果形式（见我上传的word）。。。。。谢谢
lacR promotoer.doc(35KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GTWQUBHLKVFA?p=130497
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6楼2012-11-27 09:23:49
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czdaeq

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 王贤卓 at 2012-11-27 09:23:49
你那个网站，我试了下。但结果不是我想要的！！！！我想要的结果形式（见我上传的word）。。。。。谢谢
lacR promotoer.doc(35KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GTWQUBHLKVFA?p=130497...

楼主的意思俺还是不太明白：
楼主是想要这种明确注释的么：     
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
昨天那个网站，只能告诉我们大概得启动子区域，但是既不能很精确也不能注释它的-35_signal、-10_signal；这些只能人为推测：大肠中一般统计学上，频率最高的-35：TTGACA;-10：TATAAT；然而楼主给的-35：TTGTTT;-10：TAAAAA。
这个楼主可能需要统计那个S.st的一些已注释启动子-35，-10然后看看保守情况如何（一般-35较开放形式很多，-10较保守，就几种变化）最后在用昨天的网站，预测结果亲自去推测去注释。
这种没人注释的东东，还是得自己动手丰衣主食
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7楼2012-11-27 10:09:50
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王贤卓

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by czdaeq at 2012-11-27 10:09:50
楼主的意思俺还是不太明白：
楼主是想要这种明确注释的么：     
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
昨天那个网站，只能告诉我们大概得启动子区域，但是既不能很精确也不能注释它的-35_signal、- ...

导师就这样的注释。。。没办法。。。发的word中序列只是个模式。。。
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8楼2012-11-27 17:28:20
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颜露露

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 王贤卓 at 2012-11-27 17:28:20
导师就这样的注释。。。没办法。。。发的word中序列只是个模式。。。...

你有启动子预测软件么?在这方面下下功夫？导师也没说错，
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
不一定非得是-35和-10；这是启动子识别位点，你按照序列特征在此基因上游寻找一下呢？
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9楼2014-03-26 17:31:51
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