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王贤卓

金虫 (正式写手)

[求助] 利用NCBI,查询乳酸乳球菌的乳糖操纵子中的Lac A 基因启动子序列 已有1人参与

谁会查该启动子序列,或者只要会查询启动子序列的大神,请求指教。。。金币不是问题

[ 来自科研家族 生物医药家族 ]
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王贤卓

金虫 (正式写手)

谁会,求大神啊。。。
2楼2012-11-23 17:40:06
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王贤卓

金虫 (正式写手)

3楼2012-11-25 14:38:09
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王贤卓

金虫 (正式写手)

求助啊。。。
4楼2012-11-26 14:20:48
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czdaeq

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
王贤卓: 金币+5, ★★★很有帮助, 让知道另外一种查启动序列的方法 2012-11-27 09:19:08
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助 2012-11-27 10:58:25
楼主有序列么?
授人以鱼不如授人以渔:http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html
5楼2012-11-26 21:23:49
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王贤卓

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by czdaeq at 2012-11-26 21:23:49
楼主有序列么?
授人以鱼不如授人以渔:http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html

你那个网站,我试了下。但结果不是我想要的!!!!我想要的结果形式(见我上传的word)。。。。。谢谢
lacR promotoer.doc(35KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GTWQUBHLKVFA?p=130497
6楼2012-11-27 09:23:49
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czdaeq

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 王贤卓 at 2012-11-27 09:23:49
你那个网站,我试了下。但结果不是我想要的!!!!我想要的结果形式(见我上传的word)。。。。。谢谢
lacR promotoer.doc(35KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GTWQUBHLKVFA?p=130497...

楼主的意思俺还是不太明白:
楼主是想要这种明确注释的么:     
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
昨天那个网站,只能告诉我们大概得启动子区域,但是既不能很精确也不能注释它的-35_signal、-10_signal;这些只能人为推测:大肠中一般统计学上,频率最高的-35:TTGACA;-10:TATAAT;然而楼主给的-35:TTGTTT;-10:TAAAAA。
这个楼主可能需要统计那个S.st的一些已注释启动子-35,-10然后看看保守情况如何(一般-35较开放形式很多,-10较保守,就几种变化)最后在用昨天的网站,预测结果亲自去推测去注释。
这种没人注释的东东,还是得自己动手丰衣主食
7楼2012-11-27 10:09:50
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王贤卓

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by czdaeq at 2012-11-27 10:09:50
楼主的意思俺还是不太明白:
楼主是想要这种明确注释的么:     
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
昨天那个网站,只能告诉我们大概得启动子区域,但是既不能很精确也不能注释它的-35_signal、- ...

导师就这样的注释。。。没办法。。。发的word中序列只是个模式。。。
8楼2012-11-27 17:28:20
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颜露露

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 王贤卓 at 2012-11-27 17:28:20
导师就这样的注释。。。没办法。。。发的word中序列只是个模式。。。...

你有启动子预测软件么?在这方面下下功夫?导师也没说错,
-35_signal      45..51
-10_signal      68..74
不一定非得是-35和-10;这是启动子识别位点,你按照序列特征在此基因上游寻找一下呢?
9楼2014-03-26 17:31:51
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