24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1096  |  回复: 5

碧海椰树

木虫 (小有名气)

[求助] 求助 查找基因序列

最近在研究一个基因ompr,该基因在大肠杆菌里面的序列以及作用机制研究的十分透彻,但是在我研究的菌株(已测序)里面搜索,找到14个疑似基因,想问下可以用什么方法确定一下该基因我研究的菌株里的序列?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对,看看哪个同源性最高,另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列
生物化学与分子生物学
2楼2012-09-18 14:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

碧海椰树

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lidonghong at 2012-09-18 14:36:22
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对,看看哪个同源性最高,另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列

比对的结果很失望,同源性不到50%,真么低都不知道怎么办才好,无论如何还是谢谢你!
3楼2012-09-21 14:57:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2012-09-24 05:58:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by 碧海椰树 at 2012-09-21 14:57:49
比对的结果很失望,同源性不到50%,真么低都不知道怎么办才好,无论如何还是谢谢你!...

这么低啊 那就从你那个基因的保守序列或特征序列下手 分析分析
生物化学与分子生物学
4楼2012-09-23 12:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

那你怎么找到的14个疑似基因的,怎么判断的?
5楼2012-09-24 05:56:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

你对比的是核酸序列还是蛋白序列?有些同源基因蛋白序列的identity只有30-40%,要具体情况具体分析。
6楼2012-09-25 13:18:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 碧海椰树 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 080100力学316求调剂 +3 L_Hairui 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:26 by JourneyLucky
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-07 18:45 by 求调剂zz
[考研] 一志愿西电085401求调剂 +4 sunw1306 2026-04-07 4/200 2026-04-07 16:40 by 啵啵啵0119
[考研] 372求调剂 +4 jj涌77 2026-04-02 4/200 2026-04-07 09:31 by 白云朵朵飞
[考研] 277工科求调剂 +10 1915668 2026-04-04 11/550 2026-04-06 23:53 by 心媛意北
[考研] 269电子信息求调剂,可转专业 +5 独酌wl 2026-04-06 5/250 2026-04-06 17:23 by 土木硕士招生
[考研] 085405软件工程301分求调剂,专硕可跨专业,四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:13 by jj987
[考研] 377求调剂 +6 by.ovo 2026-04-05 6/300 2026-04-05 22:18 by dongzh2009
[考研] 0832食品科学与工程学硕282调剂 +6 鱼在水中游a 2026-04-02 9/450 2026-04-05 11:45 by flysky1234
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 341求调剂 +3 学无止境,冲 2026-04-05 3/150 2026-04-05 09:40 by lbsjt
[考研] 环境285分,过六级,求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 一志愿华北电力大学(北京),材料科学与工程学硕265,求调剂 +11 yelck 2026-04-03 12/600 2026-04-04 19:52 by dongzh2009
[考研] 复试调剂 +6 范根培 2026-04-04 6/300 2026-04-04 14:27 by 土木硕士招生
[考研] 311求调剂 +11 勇敢的小吴 2026-04-02 11/550 2026-04-03 21:46 by qlm5820
[考研] 求调剂机会 +5 意染ivy 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:13 by qoooooo614
[考研] 11408,284分,二战真诚求调剂 +4 12.27 2026-04-02 4/200 2026-04-03 14:14 by dxiaoxin
[考研] 22408 266求调剂 +3 masss11222 2026-04-02 3/150 2026-04-02 18:11 by 笔落锦州
信息提示
请填处理意见