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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助 查找基因序列
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碧海椰树

木虫 (小有名气)

[求助] 求助 查找基因序列

最近在研究一个基因ompr，该基因在大肠杆菌里面的序列以及作用机制研究的十分透彻，但是在我研究的菌株（已测序）里面搜索，找到14个疑似基因，想问下可以用什么方法确定一下该基因我研究的菌株里的序列？
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1楼2012-09-18 09:09:49
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

你对比的是核酸序列还是蛋白序列？有些同源基因蛋白序列的identity只有30-40%，要具体情况具体分析。
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6楼2012-09-25 13:18:34
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对，看看哪个同源性最高，另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列
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生物化学与分子生物学
2楼2012-09-18 14:36:22
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碧海椰树

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lidonghong at 2012-09-18 14:36:22
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对，看看哪个同源性最高，另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列

比对的结果很失望，同源性不到50%，真么低都不知道怎么办才好，无论如何还是谢谢你！
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3楼2012-09-21 14:57:49
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2012-09-24 05:58:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by 碧海椰树 at 2012-09-21 14:57:49
比对的结果很失望，同源性不到50%，真么低都不知道怎么办才好，无论如何还是谢谢你！...

这么低啊 那就从你那个基因的保守序列或特征序列下手 分析分析
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生物化学与分子生物学
4楼2012-09-23 12:34:41
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