24小时热门版块排行榜    

查看: 1080  |  回复: 5

碧海椰树

木虫 (小有名气)

[求助] 求助 查找基因序列

最近在研究一个基因ompr,该基因在大肠杆菌里面的序列以及作用机制研究的十分透彻,但是在我研究的菌株(已测序)里面搜索,找到14个疑似基因,想问下可以用什么方法确定一下该基因我研究的菌株里的序列?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对,看看哪个同源性最高,另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列
生物化学与分子生物学
2楼2012-09-18 14:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

碧海椰树

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lidonghong at 2012-09-18 14:36:22
把你找到得14个疑似基因序列和大肠杆菌中的该基因序列进行比对,看看哪个同源性最高,另外该基因有没有什么特定的序列等 结合一些相关的序列特征 确定14个是否有你想要的目的基因序列

比对的结果很失望,同源性不到50%,真么低都不知道怎么办才好,无论如何还是谢谢你!
3楼2012-09-21 14:57:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2012-09-24 05:58:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by 碧海椰树 at 2012-09-21 14:57:49
比对的结果很失望,同源性不到50%,真么低都不知道怎么办才好,无论如何还是谢谢你!...

这么低啊 那就从你那个基因的保守序列或特征序列下手 分析分析
生物化学与分子生物学
4楼2012-09-23 12:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

那你怎么找到的14个疑似基因的,怎么判断的?
5楼2012-09-24 05:56:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

你对比的是核酸序列还是蛋白序列?有些同源基因蛋白序列的identity只有30-40%,要具体情况具体分析。
6楼2012-09-25 13:18:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 碧海椰树 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 296求调剂 +3 www_q 2026-03-18 6/300 2026-03-19 22:28 by zhq0425
[考研] 生物学调剂招人!!! +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +5 Doleres 2026-03-19 5/250 2026-03-19 20:14 by 制度的
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +11 yangfz 2026-03-17 11/550 2026-03-19 15:06 by houyaoxu
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +3 llllkkkhh 2026-03-18 3/150 2026-03-19 14:22 by houyaoxu
[考研] 化学求调剂 +3 临泽境llllll 2026-03-17 4/200 2026-03-19 13:59 by houyaoxu
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-19 3/150 2026-03-19 13:36 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +6 司空. 2026-03-18 6/300 2026-03-18 23:03 by 星空星月
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
信息提示
请填处理意见