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zhangxuliang

铜虫 (初入文坛)

[交流] 已知一段启动子序列,如何查找它可能在哪些基因中起作用 已有4人参与

大家好,我想了解一下,我已知一段启动子序列,如何查找它可能在哪些基因中起作用呢,小鼠的基因组,谢啦!
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轻5飞扬

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1. try blast your seq with mice genome (ucsc) , then you may find gene on either upstream or downstream
2. use such seq drive GFP or luciferase, then make a transgenic line to see where the reporter gene expresses.
3. use genomatix to do a TF analysis, to see any TF could bind to such seq, then based on TF to predict the expression of such promoter
2楼2013-04-07 21:46:57
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baby1987

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼上是高手啊,差不多这个思路。
加油。
3楼2013-04-07 21:58:17
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niuyee

银虫 (小有名气)

路过 学习一下
4楼2013-04-08 12:14:11
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Jay_C

新虫 (初入文坛)

2楼高手啊!
5楼2014-06-04 10:26:30
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