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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 查找鲤鱼β-actin基因的启动子序列
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hermit_sama

金虫 (小有名气)

[求助] 查找鲤鱼β-actin基因的启动子序列

我想要知道鲤鱼β-actin基因的启动子，最好是能表明各个外显子的位置。
另外，还想问一下一般要是NCBI没有的话，我应该去哪里找启动子的序列？
请各位达人帮忙，万分感谢。
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1楼 2011-06-09 14:45:53
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bio-research

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): Good! And I think that 1~2 kb upstream of the start coden will be OK. 2011-06-09 23:46:16
hermit_sama(金币+4): 谢谢帮助 2011-06-10 15:21:33
clone  upstream sequence of the first coden AUG of  β-actin, then sequence it.
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家有小子初长成!(Nothing is impossible to a willing heart!)
2楼2011-06-09 23:21:44
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terry130

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

hermit_sama(金币+2): 谢谢帮助 2011-06-10 15:22:06
如果数据库中没有的话，按楼上方法拿到5' flanking 序列3kb左右去做CPG island分析或者用一些专门的promoter prediction 软件分析。
赞一下 回复此楼
摒气动方息，宁神心自明。
3楼2011-06-10 07:36:37
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hbuwinscavin

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

找篇相关文献看看，NCBI没有序列一般别的地方应该不会有。NCBI世界上收集序列最全的
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4楼2011-06-10 09:54:56
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