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zhangxuliang

铜虫 (初入文坛)

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[交流] 已知一段启动子序列，如何查找它可能在哪些基因中起作用已有4人参与

大家好，我想了解一下，我已知一段启动子序列，如何查找它可能在哪些基因中起作用呢，小鼠的基因组，谢啦！

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1楼2013-04-07 19:51:00

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1. try blast your seq with mice genome (ucsc) , then you may find gene on either upstream or downstream
2. use such seq drive GFP or luciferase, then make a transgenic line to see where the reporter gene expresses.
3. use genomatix to do a TF analysis, to see any TF could bind to such seq, then based on TF to predict the expression of such promoter