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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何用NCBI查找一段基因序列的启动子？
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冷眼倦天涯

金虫 (小有名气)

[求助] 如何用NCBI查找一段基因序列的启动子？已有3人参与

如何用NCBI查找一段基因序列的启动子？急急急急
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1楼2013-10-15 22:49:37
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叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jihao1986 at 2015-11-16 21:49:42
楼上你好，我想问一下，在全基因组序列里面相邻的基因A和基因B夹着的区域是不是就包含着基因B的启动子序列？...

楼主您好，我有已知的细菌基因序列，想分析一个基因的结构，比如启动子区域，请问应该用什么预测软件呀？谢谢指教
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10楼2020-10-15 13:05:53
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紫宸成政

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-16 09:10:33
冷眼倦天涯: 金币+2 2014-01-15 10:54:53
可以先找到该基因  然后在注释中找到CDS区    从CDS区向上推2500到4000bp  具体推多少就要看文章了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2013-10-16 06:25:40
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ck8148

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
冷眼倦天涯: 金币+1 2014-01-15 10:55:26
在TAIR网址上面找拟南芥的，很全，但只是相似序列
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3楼2013-10-17 11:31:08
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tom8559

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
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冷眼倦天涯: 金币+1, ★有帮助 2014-01-15 10:54:39
这个网站可能会有帮助，当真正找到启动子序列很难，一般都是预估多少bp吧。http://wenku.baidu.com/view/fd76162e0066f5335a8121b5.html
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4楼2013-10-17 11:42:20
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