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由基因缩写名如何寻找到基因号？
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月之光羽
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[交流]
由基因缩写名如何寻找到基因号？
各位虫友：
最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名的，郁闷中，希望大家帮帮小弟的忙。
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1楼
2011-05-25 20:22:30
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cdl007
木虫
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月之光羽(金币
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aspergillus oryzae PrtR
AO 0090 (ao是aspergillus oryzae 的意思) 0090 不知道是啥。。。
LOCUS AB333776 3120 bp DNA
ncbi 上查到的。官方ID
个人认为这个其自己做的文库里的自己编的号吧？
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2楼
2011-05-25 20:33:10
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beautybanana
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月之光羽(金币
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Originally posted by
月之光羽
at 2011-05-25 20:22:30:
各位虫友：
最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名 ...
如：aspergillus oryzae PrtR 在ncbi里选择nucleotide 再在search 一栏里输入aspergillus oryzae PrtR 点seach，打开窗口后再内容里有GenBank: AB333776.1
一项，AB333776为基因号，在ncbi里选择nucleotide,在search一栏里输入基因号也可以找到对应的基因
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3楼
2011-05-26 11:00:17
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wuyucool
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楼上的正解
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4楼
2011-05-26 11:01:48
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西瓜
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Originally posted by
月之光羽
at 2011-05-25 20:22:30:
各位虫友：
最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名 ...
话说，诸如PrtR这类名称就是这个基因的名称了，不是叫缩写名啦。
当然，基因的名称是有意义的，是几个词的缩写，但PrtR就是这个基因的正式名称。你用这个名称到NCBI上搜索就能找到相关信息了。
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5楼
2011-05-26 12:44:00
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