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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 由基因缩写名如何寻找到基因号？
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月之光羽

木虫 (小有名气)

[交流] 由基因缩写名如何寻找到基因号？

各位虫友：
    最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae  PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名的，郁闷中，希望大家帮帮小弟的忙。
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1楼2011-05-25 20:22:30
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★
月之光羽(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 月之光羽 at 2011-05-25 20:22:30:
各位虫友：
    最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae  PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名 ...

话说，诸如PrtR这类名称就是这个基因的名称了，不是叫缩写名啦。
当然，基因的名称是有意义的，是几个词的缩写，但PrtR就是这个基因的正式名称。你用这个名称到NCBI上搜索就能找到相关信息了。
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5楼2011-05-26 12:44:00
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cdl007

木虫 (正式写手)
★
月之光羽(金币+1):谢谢参与
aspergillus oryzae  PrtR
AO 0090 (ao是aspergillus oryzae  的意思) 0090 不知道是啥。。。
LOCUS       AB333776                3120 bp    DNA     
ncbi 上查到的。官方ID

个人认为这个其自己做的文库里的自己编的号吧？
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2楼2011-05-25 20:33:10
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beautybanana

木虫 (著名写手)
★
月之光羽(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 月之光羽 at 2011-05-25 20:22:30:
各位虫友：
    最近实验遇到一些困难，从文献中看到的一些基因，只有给出了缩写名，比如我看到米曲霉基因aspergillus oryzae  PrtR ,但是不知道怎么能找到它的基因号，米曲霉基因号都是AO0900.。。。。这样命名 ...

如：aspergillus oryzae  PrtR   在ncbi里选择nucleotide 再在search 一栏里输入aspergillus oryzae  PrtR  点seach，打开窗口后再内容里有GenBank: AB333776.1
一项，AB333776为基因号，在ncbi里选择nucleotide,在search一栏里输入基因号也可以找到对应的基因
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3楼2011-05-26 11:00:17
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