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cxb-abc

银虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一段已知序列的DNA片段是属于启动子区?编码区 ? 已有2人参与

已知一段DNA学列,请教各位如何确定该序列在启动子区?还是编码区?或非编码区?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 应助指数+1 2014-05-27 19:03:02
用你的序列做blastn和blastx分析,根据比对结果中相似性最大的序列的注释信息推测你的序列。
2楼2014-05-25 12:03:02
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cxb-abc

银虫 (小有名气)

关键是blastn 和blastx后,能找到相似度最大的序列,问题是怎么确定?
3楼2014-05-27 16:37:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by cxb-abc at 2014-05-27 16:37:15
关键是blastn 和blastx后,能找到相似度最大的序列,问题是怎么确定?

打开比对相似度最大的序列的超链接,看下该序列的注释,是编码区?还是完整基因?然后看你自己的序列对应的是哪一个区。
4楼2014-05-27 21:53:15
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

到NCBI blast 一下就知道了
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
谢谢!
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
5楼2014-05-27 21:58:59
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