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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定一段已知序列的DNA片段是属于启动子区？编码区 ？
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cxb-abc

银虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一段已知序列的DNA片段是属于启动子区？编码区 ？ 已有2人参与

已知一段DNA学列，请教各位如何确定该序列在启动子区？还是编码区？或非编码区？
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1楼 2014-05-24 17:37:18
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 应助指数+1 2014-05-27 19:03:02
用你的序列做blastn和blastx分析，根据比对结果中相似性最大的序列的注释信息推测你的序列。
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2楼2014-05-25 12:03:02
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cxb-abc

银虫 (小有名气)
关键是blastn 和blastx后，能找到相似度最大的序列，问题是怎么确定？
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3楼2014-05-27 16:37:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by cxb-abc at 2014-05-27 16:37:15
关键是blastn 和blastx后，能找到相似度最大的序列，问题是怎么确定？

打开比对相似度最大的序列的超链接，看下该序列的注释，是编码区？还是完整基因？然后看你自己的序列对应的是哪一个区。
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4楼2014-05-27 21:53:15
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

到NCBI blast 一下就知道了
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
谢谢！
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
5楼2014-05-27 21:58:59
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