| 查看: 1849 | 回复: 6 | ||
[求助]
16S鉴定及新菌判定问题 已有3人参与
|
| 我最近在对细菌16SrRNA进行测序，但是将一些测序的结果进行Blast同源性分析发现相似性小于97%，按理说应该是初步确定为新菌，细看比对结果发现，相似性较低的区域好多都分布在3‘端或5’端，所以觉得有些奇怪，会不会是在PCR的过程中出现的问题？还是确实就是新菌？我每个重复测了三次，但是结果都是一样的。还请大家帮忙！！谢谢~~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
A期刊撤稿
已经有5人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有8人回复
-
26申博自荐
已经有7人回复
-
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗？
已经有4人回复
-
带资进组求博导收留
已经有9人回复
-
求助大佬们，伤口沾上了乙腈
已经有6人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有9人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求教关于使用16s RDNA对细菌鉴定时，关于构建系统发育树的问题。
已经有12人回复
- 知道亚种如何找现成的16S rRNA鉴定引物？
已经有12人回复
- 关于芽孢杆菌16S rRNA鉴定的疑问
已经有16人回复
- 测得细菌全基因组序列可以投哪些期刊
已经有22人回复
- 16s RNA鉴定细菌测序需要多少钱
已经有12人回复
- 关于16S 提取菌种鉴定
已经有7人回复
- 为什么细菌鉴定需要结合生理生化和16S rDNA鉴定
已经有3人回复
- 救急：如何确定同一个种的两株菌是否为同一株菌
已经有27人回复
- 一个细菌测序后的基因与genbank里比对最大相似度只有90%，什么原因？
已经有12人回复
- 用16S测序鉴定单一菌株的困惑
已经有15人回复
- 微生物鉴定时的16s rRNA 16s rDNA
已经有4人回复
- 一个菌株和最高同源性的菌，构建系统发育树两个菌不在一起
已经有10人回复
- 16S rDNA 鉴定细菌的方法及其注意事项
已经有236人回复
- 细菌亲缘关系疑问
已经有9人回复
- 16S鉴定种属（2个可变区）
已经有5人回复
- 16s鉴定是植物乳杆菌，为何生理生化鉴定不一样？
已经有5人回复
- 大肠杆菌系统鉴定方法
已经有6人回复
- 细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌，得到accession number吗？
已经有12人回复
- 关于筛选和鉴定细菌(16S rRNA)
已经有35人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 【原创】16S rRNA鉴定
已经有10人回复
- 【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题
已经有6人回复
- 【求助/交流】16s进化树+细菌鉴定 达人 请进~~~
已经有5人回复
BinBinzjb
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2.6
- 帖子: 23
- 在线: 28.6小时
- 虫号: 3012867
- 注册: 2014-03-03
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2015-01-14 16:52:00
3楼2015-01-14 16:57:22
BinBinzjb
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2.6
- 帖子: 23
- 在线: 28.6小时
- 虫号: 3012867
- 注册: 2014-03-03
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
4楼2015-01-14 17:07:26
microbhbu
新虫 (小有名气)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 1156.8
- 红花: 2
- 帖子: 147
- 在线: 37.9小时
- 虫号: 2803159
- 注册: 2013-11-15
- 性别: MM
- 专业: 微生物资源与分类学
5楼2015-01-15 06:26:11
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bikexmx: 金币+9 2015-01-16 09:10:49
感谢参与，应助指数 +1
bikexmx: 金币+9 2015-01-16 09:10:49
|
??????f?? PCR?^???п?????в???DNA???Юa???`?? ?l???????e?`??C???????????ε???????(3'??5'??)?? ???????????????L?????a???? ????16S rDNA?????β????L????????Д???N??????? ??????Д????М?_??? ????}?u??16S rDNA?????L?????1500 bp????? ?x???????Εr?????????S??????????D?V(???peak??D?V?????peak???????base)?? peak????sharp?????_?????? ????????Y?x???????ι????c?L??? ?@???NCBI blast??_??????(?p???`??)?? ???? ????N?a????????????16S rDNA?? ???????Щ??????????????y???????? ex: gyrB gene??recA??? ???DNA-DNA hybridization?? ??????????????????y??? ?????????Y??????fatty acid??quinone?M???? ?@???a???Y???????^??_...... |
6楼2015-01-15 08:41:45
clark2010
金虫 (小有名气)
- 应助: 30 (小学生)
- 金币: 2714.8
- 红花: 4
- 帖子: 80
- 在线: 80.2小时
- 虫号: 1115552
- 注册: 2010-10-07
- 专业: 环境微生物学
7楼2015-01-15 08:51:06