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16S鉴定及新菌判定问题 已有3人参与
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| 我最近在对细菌16SrRNA进行测序，但是将一些测序的结果进行Blast同源性分析发现相似性小于97%，按理说应该是初步确定为新菌，细看比对结果发现，相似性较低的区域好多都分布在3‘端或5’端，所以觉得有些奇怪，会不会是在PCR的过程中出现的问题？还是确实就是新菌？我每个重复测了三次，但是结果都是一样的。还请大家帮忙！！谢谢~~~ |
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??????f?? PCR?^???п?????в???DNA???Юa???`?? ?l???????e?`??C???????????ε???????(3'??5'??)?? ???????????????L?????a???? ????16S rDNA?????β????L????????Д???N??????? ??????Д????М?_??? ????}?u??16S rDNA?????L?????1500 bp????? ?x???????Εr?????????S??????????D?V(???peak??D?V?????peak???????base)?? peak????sharp?????_?????? ????????Y?x???????ι????c?L??? ?@???NCBI blast??_??????(?p???`??)?? ???? ????N?a????????????16S rDNA?? ???????Щ??????????????y???????? ex: gyrB gene??recA??? ???DNA-DNA hybridization?? ??????????????????y??? ?????????Y??????fatty acid??quinone?M???? ?@???a???Y???????^??_...... |
6楼2015-01-15 08:41:45
BinBinzjb
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