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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 16S鉴定种属（2个可变区）
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jlf8858

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16S鉴定种属（2个可变区）

小的做了454，得到16s两个可变区的序列，400-500bp，这能鉴定到属么？希望有虫友解答，谢谢啦！
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1楼2013-01-16 17:14:35
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四裤全输123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jlf8858: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-01-16 21:43:57
454可以到属的~现在读长都可以到600+bp，你得到的序列不用拼接，直接与数据库比对就可以
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2楼2013-01-16 20:42:24
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jlf8858

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 四裤全输123 at 2013-01-16 20:42:24
454可以到属的~现在读长都可以到600+bp，你得到的序列不用拼接，直接与数据库比对就可以

谢谢！
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3楼2013-01-16 21:43:45
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xiaoyu1014126

木虫 (正式写手)
454的读长是可以到属的，但是读长长了难免精确性会有点影响的
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4楼2013-01-16 22:39:38
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zhaoghit

金虫 (正式写手)
不是你所有的序列能鉴定到属，片段过长会影响比对精度，400以上部分还是能鉴定到属水平
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天道酬勤！
5楼2013-01-17 09:12:47
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wangya988317

铜虫 (著名写手)
不能鉴定到属的！
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6楼2013-02-07 14:37:18
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