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HSY郡主

新虫 (初入文坛)

[求助] 目的基因和表达载体连接不上,求指导!!! 已有3人参与

我的目的基因2.2k,送去公司直接合成的。合成后的目的基因连接在puc57载体上,质粒大小为4.9k,其中目的基因2.2k,puc57载体本身2.7k。以质粒为模板进行pcr,胶回收目的片段,然后双酶切(bamh1和ecor1)目的片段和表达载体pyes2(5.9k),连接,转化。平板顺利长菌了,菌落pcr结果为阳性,提质粒酶切以后,却惊奇的发现两条带的大小约为2.2k和2.7k!!!!质粒竟然是最初的“目的基因+puc57载体”,而不是自己想要的“目的基因+pyes2载体”!!!全是假阳性,没有我想要构建的质粒,why?!!!
       我明明已经切胶回收了,按说不应该污染这么多当时pcr做模板的质粒啊,新手上路,求大家指导!
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wanglei512

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用重叠pcr,扩目的基因的上下游引物两段含有pyes2载体(bamh1和ecor1之间),扩pyes2载体的上下游引物含有目的基因的两段。回收两个片段,再PCR扩增,形成多聚体后,直接转化。
9楼2014-12-10 15:51:29
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wanglei512

金虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by HSY郡主 at 2014-12-11 13:21:58
不太明白怎么回事。。。形成的多聚体是线性的吧?转化进去以后可以自己形成想要构建的载体吗?...

没有问题,重叠PCR已经形成环了,实验室已经运用的很熟练了,而且这种方法对感受态的要求很低,网上有很多关于重叠pcr,或多片段直接组装的文章,你可以查查,说的很明白
12楼2014-12-11 20:12:32
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wanglei512

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

还有一种解决的办法,把你的PCR产物双酶切后连到一个KANA抗性的载体上,并且这个载体在4k以上,方便酶切(这样即便是你回收的片段里有质粒污染,但污染进去的质粒是AMP抗性的,在KANA抗性的平板上不会长的),然后再酶切回收一次这个片段,连接pyes2载体,这时如果你的酶切片段有质粒污染(可能性比较低),但污染质粒是KANA抗性的,在AMP抗性的平板上是不会长的,一切问题都解决了
13楼2014-12-11 20:22:27
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