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muyuchc

木虫 (小有名气)

[求助] western抗体是怎么识别蛋白一级序列的 已有7人参与

有的western抗体是识别蛋白一级序列的,请问是怎么特异性识别的?
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xiaoyugutou

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-11-19 08:22:30
Maybe when they make antibody they immuned animals with peptides, so the antibody can recognize the primary sequence of protein as an antigen.
2楼2014-11-19 06:07:14
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muyuchc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoyugutou at 2014-11-19 06:07:14
Maybe when they make antibody they immuned animals with peptides, so the antibody can recognize the primary sequence of protein as an antigen.

这个清楚,有没有具体的原理去识别的一级序列?
3楼2014-11-19 10:06:51
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
muyuchc: 金币+10 2014-11-20 19:17:01
大多数情况下,抗体的制备是通过一级序列去制备的。

简单的回顾下抗体的制备方法
1构建表达载体
2原核表达
3纯化蛋白
4免疫动物制备抗体

发现没,经过1,2,3步骤,这是原核表达步骤,原核表达的蛋白
1没有活性,
2多肽为主。

因为原核表达的蛋白
1缺乏真核表达所需要的酶,所以无法正确折叠成蛋白
2缺乏真核表达所需要的内环境,细胞器等
3原核表达以包涵体表达为主,所以,经过那么强烈的ph变化和尿素处理最后纯化出来的蛋白,有活性才怪,基本上就是条肽链

那么,以上问题解决了,答案就很明显了,你用的一级序列去制备抗体,那么抗体能够识别的, 自然是一级序列了

然后问题来了,这种情况下,事实上,抗体是不特异的。所以,极少见那些可以用自己制备抗体做出非常单一漂亮的wb图片的
所以,如何解决?单克隆抗体嘿嘿,牛一点咋办,直接从生物里提取活的抗体,那样最有用,生化危机啦,猿星崛起啦,都是这么干的。
天行健
4楼2014-11-19 10:42:55
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

以上内容主要是解决了你的标题问题

然后,问,有没方法去识别一级序列?

a,活性情况下,无法识别。这个如果非要是生物体内部的话,自然有方法了,相应的酶和结构会处理的

b,无活性情况下,可以识别。简单方法就是变性,成为了肽链,然后去测蛋白质序列就可以了,1953年,sanger最初就是测了胰岛素序列吧。
现在的话,一般是用打质谱然后拼接。

以上内容,答非所问。
天行健
5楼2014-11-19 10:52:56
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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muyuchc: 金币+20, ★有帮助 2014-11-20 19:16:45
针对线性表位的抗体都是特异性地识别一小段肽段的。抗体蛋白有一个特定的三维结构,多肽也有一个特定的三维结构,两个结构是互补的,碰到一起就相互结合了。有点类似于手套和手,假设手套是抗体,手是抗原,两者凑到一块之后,在合适的取向下他们就能结合到一起了。抗体-抗原结合的原理还涉及变构调节,这些在分子生物学和免疫学里都有描述。
6楼2014-11-19 12:27:27
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muyuchc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-11-19 10:52:56
以上内容主要是解决了你的标题问题

然后,问,有没方法去识别一级序列?

a,活性情况下,无法识别。这个如果非要是生物体内部的话,自然有方法了,相应的酶和结构会处理的

b,无活性情况下,可以识别。简单 ...

谢谢,我说的识别一级序列,是抗体怎么去特异性识别一级序列的,不是它的氨基酸序列,当然上面你也说了,识别一级序列不会有很好的特异性。
7楼2014-11-20 11:10:43
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

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引用回帖:
7楼: Originally posted by muyuchc at 2014-11-20 11:10:43
谢谢,我说的识别一级序列,是抗体怎么去特异性识别一级序列的,不是它的氨基酸序列,当然上面你也说了,识别一级序列不会有很好的特异性。...

抗体本身就是i一级序列制备,所以跟一级序列匹配。至于识别过程,蛋白质互作。实质上是匹配抗原表位与抗体超变区中抗原结合点之间的结合。由于两者在化学结构和空间构型上呈互补关系,所以可以识别
天行健
8楼2014-11-20 11:17:09
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
缘分到了就识别了,而且特异性是相对的。
9楼2014-11-20 11:18:13
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muyuchc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liuderong at 2014-11-19 12:27:27
针对线性表位的抗体都是特异性地识别一小段肽段的。抗体蛋白有一个特定的三维结构,多肽也有一个特定的三维结构,两个结构是互补的,碰到一起就相互结合了。有点类似于手套和手,假设手套是抗体,手是抗原,两者凑到 ...

识别的一级序列即一小段肽段,其也是有个三维结构的,这种结构特异性高,制作的识别这段肽段的抗体特异性就相对较高,是吧?谢谢你,学习了。
10楼2014-11-20 11:19:51
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