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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 将蛋白质序列怎么转为CDS
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sjjsy7

银虫 (小有名气)

[求助] 将蛋白质序列怎么转为CDS

本人要设计引物，然后发现只能找到AA序列，所以 请问各位如何将一个蛋白质的AA序列转为CDs?
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1楼 2012-09-28 23:53:44
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gj1018

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
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sjjsy7: 金币+1 2012-09-29 19:36:30
根据AA密码子翻译序列。你再找找一般有AA序列，就会有mRNA序列的。
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2楼2012-09-29 07:11:40
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和一

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-09-29 14:47:19
sjjsy7: 金币+1 2012-09-29 19:37:28
自己是无法通过AA序列反推碱基序列的，但如果NCBI的数据库中能查到氨基酸的序列，肯定也给出了碱基序列，你再好好找找，实在找不到，把基因的名字发上来，大家可以帮你找
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3楼2012-09-29 08:54:25
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sjjsy7: 金币+1 2012-09-29 19:37:59
可到NCBI里用tblastN比对就可以了哈
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4楼2012-09-29 09:17:14
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once1015

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sjjsy7: 金币+1 2012-09-29 19:39:40
NCBI 蛋白序列出来之后 最下面 有一个CDS 的链接 ，可以直接到 基因组DNA上 找到相应的
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5楼2012-09-29 13:09:08
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
很简单，把aa序列输入到mega软件中，点击对应的dna序列，立马就出来了
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生物化学与分子生物学
6楼2012-09-29 15:50:33
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sjjsy7

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gj1018 at 2012-09-29 07:11:40
根据AA密码子翻译序列。你再找找一般有AA序列，就会有mRNA序列的。

好，我找找!!
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7楼2012-09-29 19:36:24
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sjjsy7

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 和一 at 2012-09-29 08:54:25
自己是无法通过AA序列反推碱基序列的，但如果NCBI的数据库中能查到氨基酸的序列，肯定也给出了碱基序列，你再好好找找，实在找不到，把基因的名字发上来，大家可以帮你找

知道了！！我找找！！！
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8楼2012-09-29 19:37:24
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sjjsy7

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by chenguestc at 2012-09-29 09:17:14
可到NCBI里用tblastN比对就可以了哈

好，试试看
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9楼2012-09-29 19:37:54
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sjjsy7

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by once1015 at 2012-09-29 13:09:08
NCBI 蛋白序列出来之后 最下面 有一个CDS 的链接 ，可以直接到 基因组DNA上 找到相应的

知道了，谢谢!!
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10楼2012-09-29 19:39:14
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