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wen530

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[求助] 在PDB数据库中,怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢? 已有1人参与

在PDB数据库中,怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢?输入casein,显示的都是酪蛋白激酶?请问怎样查询呢?
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wen530: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢。我还想请问您一个问题:比如我在PDB中查询脱氧核糖核酸酶Dnase序列,我找到了来源是牛胰的,但是会出现多个PDB ID,那我到底该怎样判断选择哪一个呢?如果有不同的配体与Dnase结晶,就会有多个PDB ID,那么PDB中显示的Residue Count为什么也不同呢? 2014-03-05 09:23:56
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-05 14:43:32
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧,就用你知道的序列blast,从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构,有可能查不到的。
2楼2014-03-04 21:46:09
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wen530

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-04 21:46:09
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧,就用你知道的序列blast,从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构,有可能查不到的。

那我想知道完整的Dnase氨基酸序列,该如何从PDB中查询呢?
3楼2014-03-05 14:00:35
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wen530(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 01:13:32
一般可以浏览PDB文件的软件都可以调出氨基酸的序列,你再看看软件的说明书。而在NCBI或者wiss之类的数据库里会有收录的,你根据PDB号查到PDB后,仔细看看网站的各个链接,一般都会给出序列。
4楼2014-03-05 15:57:43
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