24小时热门版块排行榜    

查看: 2682  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wen530

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 在PDB数据库中,怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢? 已有1人参与

在PDB数据库中,怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢?输入casein,显示的都是酪蛋白激酶?请问怎样查询呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wen530

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-04 21:46:09
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧,就用你知道的序列blast,从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构,有可能查不到的。

那我想知道完整的Dnase氨基酸序列,该如何从PDB中查询呢?
3楼2014-03-05 14:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wen530: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢。我还想请问您一个问题:比如我在PDB中查询脱氧核糖核酸酶Dnase序列,我找到了来源是牛胰的,但是会出现多个PDB ID,那我到底该怎样判断选择哪一个呢?如果有不同的配体与Dnase结晶,就会有多个PDB ID,那么PDB中显示的Residue Count为什么也不同呢? 2014-03-05 09:23:56
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-05 14:43:32
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧,就用你知道的序列blast,从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构,有可能查不到的。
2楼2014-03-04 21:46:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wen530(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 01:13:32
一般可以浏览PDB文件的软件都可以调出氨基酸的序列,你再看看软件的说明书。而在NCBI或者wiss之类的数据库里会有收录的,你根据PDB号查到PDB后,仔细看看网站的各个链接,一般都会给出序列。
4楼2014-03-05 15:57:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +6 梨花珞晚风 2026-03-17 6/300 2026-03-21 03:40 by JourneyLucky
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 10/500 2026-03-19 15:08 by 阳阳哇塞
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
信息提示
请填处理意见