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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » 在PDB数据库中，怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢？
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wen530

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 在PDB数据库中，怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢？ 已有1人参与

在PDB数据库中，怎么查询不到酪蛋白的氨基酸序列呢？输入casein，显示的都是酪蛋白激酶？请问怎样查询呢？
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1楼 2014-03-04 16:36:14
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wen530(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 01:13:32
一般可以浏览PDB文件的软件都可以调出氨基酸的序列，你再看看软件的说明书。而在NCBI或者wiss之类的数据库里会有收录的，你根据PDB号查到PDB后，仔细看看网站的各个链接，一般都会给出序列。
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4楼2014-03-05 15:57:43
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wen530: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢。我还想请问您一个问题：比如我在PDB中查询脱氧核糖核酸酶Dnase序列，我找到了来源是牛胰的，但是会出现多个PDB ID,那我到底该怎样判断选择哪一个呢？如果有不同的配体与Dnase结晶，就会有多个PDB ID,那么PDB中显示的Residue Count为什么也不同呢？ 2014-03-05 09:23:56
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-05 14:43:32
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧，就用你知道的序列blast，从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构，有可能查不到的。
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2楼2014-03-04 21:46:09
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wen530

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-04 21:46:09
你应该知道一些酪蛋白的氨基酸序列了吧，就用你知道的序列blast，从blast结果里看看有没有结晶。好多蛋白没有做个三维结构，有可能查不到的。

那我想知道完整的Dnase氨基酸序列，该如何从PDB中查询呢？
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3楼2014-03-05 14:00:35
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