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wwsw38

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[求助] 如何从单克隆抗体的氨基酸序列中找出其Fc区，CDR区？已有3人参与

例如下面这个单克隆抗体的序列，如何找出CDR1，2，3？
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTLTSYGISWVRQAPGQGL
EWMGWVSFYNGNTNYAQKLQGRGTMTTDPSTSTAYMELRSLRSDD
TAVYYCARGYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSE
STAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL
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KVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLT
CLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLT
VDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK

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为自己加油

1楼2014-01-20 14:39:09

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朱多龙

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-01-20 16:02:12

建议使用softberry分析下蛋白的结构，再做进一步的分析。这些区域都是有特殊结构的。

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2楼2014-01-20 15:43:24

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 朱多龙 at 2014-01-20 15:43:24
建议使用softberry分析下蛋白的结构，再做进一步的分析。这些区域都是有特殊结构的。

谢谢您的回复，现在还没搞懂softberry，我只会根据DNA序列找出CDR区FR区，但是根据氨基酸序列还不会。

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为自己加油

3楼2014-01-20 16:02:51

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没有人回复了吗

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4楼2014-01-21 10:14:41

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5楼2014-01-23 15:41:54

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匿名

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-01-25 11:45:42
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-01-26 05:54:37
wwsw38: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢您的回复，我知道从IMGT中可以根据DNA序列找CDR，但根据蛋白序列呢？ 2014-02-19 15:40:36