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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何从单克隆抗体的氨基酸序列中找出其Fc区，CDR区？
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wwsw38

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何从单克隆抗体的氨基酸序列中找出其Fc区，CDR区？ 已有3人参与

例如下面这个单克隆抗体的序列，如何找出CDR1，2，3？
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTLTSYGISWVRQAPGQGL
EWMGWVSFYNGNTNYAQKLQGRGTMTTDPSTSTAYMELRSLRSDD
TAVYYCARGYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSE
STAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL
SSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCP
APPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVQFN
WYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTFRVVSVLTVVHQDWLNGKEYKC
KVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLT
CLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLT
VDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
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为自己加油
1楼 2014-01-20 14:39:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-01-25 11:45:42
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-01-26 05:54:37
wwsw38: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢您的回复，我知道从IMGT中可以根据DNA序列找CDR，但根据蛋白序列呢？ 2014-02-19 15:40:36
本帖仅楼主可见
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6楼2014-01-23 18:44:09
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朱多龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-01-20 16:02:12
建议使用softberry分析下蛋白的结构，再做进一步的分析。这些区域都是有特殊结构的。
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2楼2014-01-20 15:43:24
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wwsw38

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 朱多龙 at 2014-01-20 15:43:24
建议使用softberry分析下蛋白的结构，再做进一步的分析。这些区域都是有特殊结构的。

谢谢您的回复，现在还没搞懂softberry，我只会根据DNA序列找出CDR区FR区，但是根据氨基酸序列还不会。
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为自己加油
3楼2014-01-20 16:02:51
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Lelouch95745

铁虫 (初入文坛)
请问楼主的序列是在哪里找到的？我也想找，谢谢告知了~~
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7楼2014-04-04 17:55:07
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