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菁菁很蛋疼

新虫 (初入文坛)

[交流] 构建真核表达载体问题

小生最近在尝试将3100bp的片段与真核质粒PC3.1连接,选择BamH1和Xho1双酶切,37℃ 6小时,T4连接酶16℃过夜,尝试6次都连不上,质粒PCR我设计了一段引物可以扩3000中的300bp,几乎每次都扩的出来,但是送测一般都是空载或者插入小于100bp。快疯了,PCR我用的pfu酶,我现在想彻底换了酶,酶切位点,载体,求大神给点意见和建议
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维真生物

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
换个载体试试,我们有penter载体

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-11-18 16:47:43
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caihang

铜虫 (小有名气)

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菁菁很蛋疼(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:02:08
送测后是空载体或小于100bp你有没有想过是什么问题?
其实这说明了
1,你的酶切不彻底
2,你在加入目标片段时,片段不纯,有杂带,胶回收试试。
3,3100的片段连上载体肯定很困难,建议每次多设几组比例进行连接。
4,xho1这个酶切位点,你去查一下,问题可能就是它。
5,片段太大可以试试别的连接方式,不一定非要用粘性末端连。
3楼2014-11-18 22:44:19
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吟啸徐行

银虫 (小有名气)

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菁菁很蛋疼(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:02:27
你的3100bp的片段是怎么得到的?从克隆载体上直接酶切下来的吗?
会不会是pfu酶的问题,我记得pfu扩增出来的平末端的片段,你要是用pfu扩增你的3100片段,变成平末端去和克隆载体连接的确不好连。
4楼2014-11-20 23:21:54
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smdsfy

铜虫 (小有名气)

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菁菁很蛋疼(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:02:35
酶切载体与酶切片段的准备是否够量,酶切后切胶回收检测浓度,再根据摩尔比1:10,酶切片段过量,但酶切载体的量也要充足,且要做好自连对照,如果在你保证酶切载体与酶切片段足够的情况下,还是不成功,那么换其他人做试试,或者换其他的方法
5楼2014-11-21 09:31:28
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cdde1234

金虫 (正式写手)


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pcr能出现,可能是试剂被污染了
6楼2014-11-21 10:00:24
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DOVElalala

铜虫 (初入文坛)


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用的KOD fx高保真酶。
7楼2015-01-14 16:34:52
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