应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 查找某个基因的转录因子
131/2返回列表12下一页
查看: 10527  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

koala596

金虫 (小有名气)

[求助] 查找某个基因的转录因子 已有3人参与

最近准备要做这方面的东西，但是之前一直没接触过，所以希望各位大神能够帮帮忙，感激不尽！

在哪里可以搜索到某个基因的上游转录因子？

我想查找某个基因（如glut2）的表达受哪些转录因子调控？另外，我还想查找这个基因（glut2）下游调控哪些因子或信号蛋白？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
1楼 2014-10-11 10:25:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

履霜

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

一个TF基因作为转录因子，它下游binding motif是什么；在这个TF基因的启动子或者上游的非编码调控区域有哪些其他因子的binding motif。
1. 有很多在线的网站可以预测，例如MEME suite，自己去读manual
2. 也有很多R的package能够解决这个问题，rGADAM，motif，直接出图。
祝好~
赞一下(1人) 回复此楼
I measured love by the extent of my jealousy...
12楼2016-09-22 01:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

cxjzly2008
★
koala596(金币+1): 谢谢参与
2楼2014-10-11 10:27:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmbb
3楼2014-10-11 10:28:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenrenren
4楼2014-10-11 10:57:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 鼓励交流 2014-10-11 11:20:59
预测的仅供参考，一般会与实际情况偏差很大，实验证明的才算数

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2014-10-11 10:58:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

koala596

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-10-11 10:58:23
预测的仅供参考，一般会与实际情况偏差很大，实验证明的才算数

但不是先通过预测，锁定几个转录因子，在通过实验证明吗？
赞一下 回复此楼
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
6楼2014-10-11 13:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

随风飘摇11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我的情况和你正好相反，我是要找转录因子下游调控的基因。昨天听报告时，那个教授说的，要么借助生物信息学分析，要么做表达谱分析。具体我也不懂。感觉你这个也很难的，多和老师去交流吧
赞一下 回复此楼
天道酬勤
7楼2014-10-11 13:19:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

koala596

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2014-10-11 13:19:59
我的情况和你正好相反，我是要找转录因子下游调控的基因。昨天听报告时，那个教授说的，要么借助生物信息学分析，要么做表达谱分析。具体我也不懂。感觉你这个也很难的，多和老师去交流吧

老板就是要我自己先去用生物信息学预测几个转录因子出来....
赞一下 回复此楼
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
8楼2014-10-11 14:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凋亡小菜鸟

新虫 (初入文坛)
你好，最近我也在做相同的工作，相同的困惑？楼主有好的解决方法了么？
赞一下 回复此楼
9楼2015-08-20 00:21:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z1211818

银虫 (正式写手)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-22 07:54:39
@koala596、@随风飘摇11
不知道两位前辈最后的结果如何？我现在也要尝试通过一个转录因子来寻找其对应的靶基因，不知道如何下手，还请两位前辈多多指教下，如果你们已经有好的方法的话。thx！
赞一下 回复此楼
10楼2016-09-20 22:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 koala596 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求材料，环境专业调剂 +3 18567500178 2026-03-18 3/150 2026-03-23 23:50 by 热情沙漠
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 333求调剂 +3 ALULU4408 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:04 by macy2011
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 315分，诚求调剂，材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 289材料与化工（085600）B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭