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koala596

金虫 (小有名气)

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[求助] 查找某个基因的转录因子已有3人参与

最近准备要做这方面的东西，但是之前一直没接触过，所以希望各位大神能够帮帮忙，感激不尽！

在哪里可以搜索到某个基因的上游转录因子？

我想查找某个基因（如glut2）的表达受哪些转录因子调控？另外，我还想查找这个基因（glut2）下游调控哪些因子或信号蛋白？

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researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging

1楼2014-10-11 10:25:54

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履霜

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

一个TF基因作为转录因子，它下游binding motif是什么；在这个TF基因的启动子或者上游的非编码调控区域有哪些其他因子的binding motif。
1. 有很多在线的网站可以预测，例如MEME suite，自己去读manual
2. 也有很多R的package能够解决这个问题，rGADAM，motif，直接出图。
祝好~

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I measured love by the extent of my jealousy...

12楼2016-09-22 01:28:01

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