24小时热门版块排行榜    

查看: 10553  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

koala596

金虫 (小有名气)

[求助] 查找某个基因的转录因子 已有3人参与

最近准备要做这方面的东西,但是之前一直没接触过,所以希望各位大神能够帮帮忙,感激不尽!

在哪里可以搜索到某个基因的上游转录因子?

我想查找某个基因(如glut2)的表达受哪些转录因子调控?另外,我还想查找这个基因(glut2)下游调控哪些因子或信号蛋白?
回复此楼
researchinterest:telomere;shelterin;DC disease ; anti-aging
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

履霜

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

一个TF基因作为转录因子,它下游binding motif是什么;在这个TF基因的启动子或者上游的非编码调控区域有哪些其他因子的binding motif。
1. 有很多在线的网站可以预测,例如MEME suite,自己去读manual
2. 也有很多R的package能够解决这个问题,rGADAM,motif,直接出图。
祝好~
I measured love by the extent of my jealousy...
12楼2016-09-22 01:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

Neo2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 鼓励交流 2014-10-11 11:20:59
预测的仅供参考,一般会与实际情况偏差很大,实验证明的才算数

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-10-11 10:58:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

koala596

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-10-11 10:58:23
预测的仅供参考,一般会与实际情况偏差很大,实验证明的才算数

但不是先通过预测,锁定几个转录因子,在通过实验证明吗?
researchinterest:telomere;shelterin;DC disease ; anti-aging
6楼2014-10-11 13:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

随风飘摇11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我的情况和你正好相反,我是要找转录因子下游调控的基因。昨天听报告时,那个教授说的,要么借助生物信息学分析,要么做表达谱分析。具体我也不懂。感觉你这个也很难的,多和老师去交流吧
天道酬勤
7楼2014-10-11 13:19:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +8 Auroracx 2026-03-22 8/400 2026-03-26 19:55 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +8 y7czhao 2026-03-26 8/400 2026-03-26 19:51 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +4 AZMK 2026-03-25 6/300 2026-03-26 16:12 by 王小欠i
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 考研调剂 +7 呼呼?~+123456 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:24 by 小小麦片
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap- 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 308求调剂 +5 墨墨漠 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:19 by 544594351
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 各位老师您好:本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 考研化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-03-23 11/550 2026-03-25 10:23 by userper
[考研] 0703化学求调剂 +6 奶油草莓. 2026-03-22 7/350 2026-03-25 10:00 by shangxh
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +4 13831862839 2026-03-24 5/250 2026-03-25 09:47 by 无际的草原
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
信息提示
请填处理意见