应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 查找某个基因的转录因子
131/2返回列表12下一页
查看: 10860  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

koala596

金虫 (小有名气)

[求助] 查找某个基因的转录因子 已有3人参与

最近准备要做这方面的东西，但是之前一直没接触过，所以希望各位大神能够帮帮忙，感激不尽！

在哪里可以搜索到某个基因的上游转录因子？

我想查找某个基因（如glut2）的表达受哪些转录因子调控？另外，我还想查找这个基因（glut2）下游调控哪些因子或信号蛋白？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
1楼 2014-10-11 10:25:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

履霜

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

一个TF基因作为转录因子，它下游binding motif是什么；在这个TF基因的启动子或者上游的非编码调控区域有哪些其他因子的binding motif。
1. 有很多在线的网站可以预测，例如MEME suite，自己去读manual
2. 也有很多R的package能够解决这个问题，rGADAM，motif，直接出图。
祝好~
赞一下(1人) 回复此楼
I measured love by the extent of my jealousy...
12楼2016-09-22 01:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

cxjzly2008
★
koala596(金币+1): 谢谢参与
2楼2014-10-11 10:27:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmbb
3楼2014-10-11 10:28:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenrenren
4楼2014-10-11 10:57:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 鼓励交流 2014-10-11 11:20:59
预测的仅供参考，一般会与实际情况偏差很大，实验证明的才算数

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2014-10-11 10:58:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

koala596

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-10-11 10:58:23
预测的仅供参考，一般会与实际情况偏差很大，实验证明的才算数

但不是先通过预测，锁定几个转录因子，在通过实验证明吗？
赞一下 回复此楼
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
6楼2014-10-11 13:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

随风飘摇11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我的情况和你正好相反，我是要找转录因子下游调控的基因。昨天听报告时，那个教授说的，要么借助生物信息学分析，要么做表达谱分析。具体我也不懂。感觉你这个也很难的，多和老师去交流吧
赞一下 回复此楼
天道酬勤
7楼2014-10-11 13:19:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

koala596

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2014-10-11 13:19:59
我的情况和你正好相反，我是要找转录因子下游调控的基因。昨天听报告时，那个教授说的，要么借助生物信息学分析，要么做表达谱分析。具体我也不懂。感觉你这个也很难的，多和老师去交流吧

老板就是要我自己先去用生物信息学预测几个转录因子出来....
赞一下 回复此楼
researchinterest：telomere；shelterin；DC disease ; anti-aging
8楼2014-10-11 14:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凋亡小菜鸟

新虫 (初入文坛)
你好，最近我也在做相同的工作，相同的困惑？楼主有好的解决方法了么？
赞一下 回复此楼
9楼2015-08-20 00:21:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z1211818

银虫 (正式写手)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-22 07:54:39
@koala596、@随风飘摇11
不知道两位前辈最后的结果如何？我现在也要尝试通过一个转录因子来寻找其对应的靶基因，不知道如何下手，还请两位前辈多多指教下，如果你们已经有好的方法的话。thx！
赞一下 回复此楼
10楼2016-09-20 22:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 koala596 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 12/600 2026-08-21 19:46 by kulium
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 14/700 2026-08-21 16:51 by applepetty
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 什么时候开奖？ +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭