| 查看: 2281 | 回复: 8 | ||||
[求助]
为什么转录因子结合很多基因调控序列却不影响基因表达？
|
| 求助各位大神：为什么转录因子结合很多基因调控序列却不影响基因表达？以及相应的实验设计方案。。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 蛋白质生物学实验经验 | 核酸生物学实验经验 |
» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有51人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 不知道一株菌的全基因组序列能否做某个基因的过表达
已经有3人回复
- 如何》在全基因组中搜索 转录因子的binding site ？
已经有4人回复
- 几条序列注释为同一个基因，但这几条序列却拼接不上，相似行也不高
已经有9人回复
- 原核生物的转录因子结合到了基因内部，可能有什么作用？
已经有3人回复
- 查找基因的转录因子
已经有11人回复
- 关于转录因子调控的下游基因
已经有13人回复
jurkat.1640
至尊木虫 (文坛精英)
- MolEPI: 1
- 应助: 905 (博后)
- 金币: 16530.5
- 散金: 1654
- 红花: 120
- 沙发: 41
- 帖子: 14454
- 在线: 2171.1小时
- 虫号: 514340
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
2楼2013-11-10 11:11:19
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 丽丽好人！ 2013-11-12 01:40:32
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 丽丽好人！ 2013-11-12 01:40:32
|
转录因子结合很多基因调控序列却不影响基因表达，因为接触到的那些DNA片段不是该转录因子具体作用的片段，两者只是非特异性的结合，另一种情况，该转录因子的下游蛋白质没有表达或者失活，或者是病理情况，或者再生条件下激活下游的蛋白质表达需要不止一种蛋白质因子的出现，或者需要相关的蛋白质因子达到一定的浓度阀值。 如果楼主要具体的实验设计，那么必须给出你的具体的实验条件和目的，否则没法设计。另外，我们需要具体讨论，不能光我说出数千字就没有人理我了。 |
3楼2013-11-11 00:19:40
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
4楼2013-11-11 00:21:16
5楼2013-11-11 09:55:44
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+5, 一回帖就是经典！ 2013-11-12 01:41:02
gyesang: 金币+5, 一回帖就是经典！ 2013-11-12 01:41:02
|
我在三和四楼已经回答了可能的三种原因吗？ 我让你具体说说你的转录因子的情况，比如你凭什么断定它是转录因子？还有第四个原因：它即使是转录因子也不一定就直接和DNA调控片段结合，而是可能与和DNA片段直接结合的其他因子结合，你做没做过WB，调取一下可能的结合的蛋白质？你用没用过三级结构预测出三维结构或者一直三维结构，然后根据同源蛋白质或折叠子预测其可能的生物功能？这种转录因子与哪些DNA调控序列的结合力更大？该转录因子结合力更大的那些DNA调控序列结合了那些其他的调控因子一般有神木功能？神木叫所有的调控序列？你的转录因子在什么细胞中发现？你的转录因子在细胞周期的表达量是不是有变化？其表达量最大的细胞周期最可能有功能。该转录因子不结合和DNA调控片段结合时出于什么状态？是否在细胞核？是否有和其他的蛋白质结合？ 我已经说出了可能的原因和试验方法。但是你不要总是重复题目好不好？你们做了哪些检测都依据没有提。 附录：转录因子数据库与转录因子预测软件 转录因子数据库： TRANSFAC: http://www.gene-regulation.com/pub/databses.html TRRD: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/trrd/ TFD: http://www.ifti.org/ JASPAP : http://jaspar.cgb.ki.se/ DBTSS: http://dbtess.hgc.jp/ 转录因子预测软件： March 1.0 http://compel.binet.nsc,ru/March/March.html TFSEACH http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEACH.html MAPPER http://mapper.chip.org P-March: http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html TESS http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess PatSearch http://www.ba.itb.cnr.it/BIG/PatSearch m2transfac http://explain.biobase.de/cgi-bin/m2transfac/bin/start.cgi Signal Scan http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/signal/ |
6楼2013-11-11 10:22:02
7楼2013-11-11 13:00:55
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
8楼2013-11-11 20:16:47
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
9楼2013-11-11 20:18:02