24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2599  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

[交流] 系统树如何分析

大家好:
    测序是送CCTCC测得,16S rRNA序列。
    序列BLAST后搜到几十株同源性在92%以上的菌株,选取97%以上的10株左右,最高的99%同源性然后借助MEGA5.0,Neighbor-Joining Tree分析法构建系统发育树并通过Bootstrap method 1000,在最终获得发育树,见下图。但是不知道怎么分析,因为写文章不可能就把树摆上完了,我不会专业的分析。求教专家的虫友帮忙分析一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

做好眼前的东西!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gjs713 at 2014-10-03 19:07:06
分析分两部分进行,首先说一下 你的序列跟xxx  xxx的同源性分别为多少%,跟FZB42同源性为多少%,这是blast的结果,说明从中可以看出与FZB42是具有最高的序列同源性的。
其次,根据后续的系统进化分析 进一步验证了 ...

非常感谢虫虫,那就是说BLAST中FZB42同源性为99%,与HP60同源性最高,然后建树后又与FZB42在同一最小分枝,那说明这个结果与BLAST结果一致,得出HP60与FZB42为同一种,是吧
做好眼前的东西!
8楼2014-10-03 23:10:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

xuerongtao

银虫 (小有名气)

就是这个树
系统树如何分析
AXER0OHOWU43S@KWHFXJ4W2.jpg

做好眼前的东西!
2楼2014-10-02 10:01:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lcat

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+1 2014-10-03 08:11:17
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。
5楼2014-10-02 22:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lcat at 2014-10-02 22:46:58
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。

我的菌是HP60,是和FZB42是一个种,但是呀你也知道要投高含量的文章,树的分析这块必须一针见血,说服审稿人的思想,说一句与FZB42一个种肯定是不行的
做好眼前的东西!
6楼2014-10-03 08:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 272分材料子求调剂 +28 Loy0361 2026-04-10 36/1800 2026-04-11 00:45 by success5733
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+13 化工人999 2026-04-09 47/2350 2026-04-11 00:20 by 骑牛渡寒江
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 083200 305分 求二轮调剂 不接受跨专业 +9 Claireyyyy 2026-04-09 10/500 2026-04-10 21:21 by Claireyyyy
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +17 yzyzx 2026-04-09 17/850 2026-04-10 10:29 by wp06
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-05 11/550 2026-04-10 09:32 by 钟洲2011
[考研] 268分085602化学工程调剂 +24 月照花林。 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 08:09 by Sammy2
[考研] 计算机11408,286分求调剂 +9 木子念晞 2026-04-05 9/450 2026-04-09 20:04 by vgtyfty
[考研] 0703化学求调剂 +21 不知名的小卅 2026-04-08 21/1050 2026-04-09 18:55 by l_paradox
[考研] 材料工程调剂 +12 小刘同学吖吖 2026-04-06 13/650 2026-04-09 17:07 by luoyongfeng
[考研] 299求调剂 +6 ZVVZ13 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:48 by wp06
[考研] 085600,321分求调剂 +19 大馋小子 2026-04-04 20/1000 2026-04-09 14:12 by Delta2012
[考研] 0860004 求调剂 309分 +6 Yin DY 2026-04-09 6/300 2026-04-09 10:19 by 啊李999
[考研] 353求调剂 +8 晴空万里air 2026-04-07 8/400 2026-04-09 00:18 by GouQ
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 331求调剂 +5 张元一 2026-04-07 6/300 2026-04-07 22:13 by hemengdong
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 09:25 by 小黑不怕难
[考研] 材料调剂 +14 壹贰贰亿 2026-04-04 14/700 2026-04-05 23:31 by 来看流星雨10
[考研] 328分调剂 +6 门men 2026-04-04 6/300 2026-04-05 13:40 by imissbao
信息提示
请填处理意见