24小时热门版块排行榜    

查看: 2563  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

[交流] 系统树如何分析

大家好:
    测序是送CCTCC测得,16S rRNA序列。
    序列BLAST后搜到几十株同源性在92%以上的菌株,选取97%以上的10株左右,最高的99%同源性然后借助MEGA5.0,Neighbor-Joining Tree分析法构建系统发育树并通过Bootstrap method 1000,在最终获得发育树,见下图。但是不知道怎么分析,因为写文章不可能就把树摆上完了,我不会专业的分析。求教专家的虫友帮忙分析一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

做好眼前的东西!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gjs713 at 2014-10-03 19:07:06
分析分两部分进行,首先说一下 你的序列跟xxx  xxx的同源性分别为多少%,跟FZB42同源性为多少%,这是blast的结果,说明从中可以看出与FZB42是具有最高的序列同源性的。
其次,根据后续的系统进化分析 进一步验证了 ...

非常感谢虫虫,那就是说BLAST中FZB42同源性为99%,与HP60同源性最高,然后建树后又与FZB42在同一最小分枝,那说明这个结果与BLAST结果一致,得出HP60与FZB42为同一种,是吧
做好眼前的东西!
8楼2014-10-03 23:10:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

xuerongtao

银虫 (小有名气)

就是这个树
系统树如何分析
AXER0OHOWU43S@KWHFXJ4W2.jpg

做好眼前的东西!
2楼2014-10-02 10:01:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lcat

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+1 2014-10-03 08:11:17
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。
5楼2014-10-02 22:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lcat at 2014-10-02 22:46:58
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。

我的菌是HP60,是和FZB42是一个种,但是呀你也知道要投高含量的文章,树的分析这块必须一针见血,说服审稿人的思想,说一句与FZB42一个种肯定是不行的
做好眼前的东西!
6楼2014-10-03 08:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +17 大米饭! 2026-03-15 21/1050 2026-03-21 19:18 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +7 26研0 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:06 by ColorlessPI
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 材料求调剂 +4 @taotao 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:52 by 学员8dgXkO
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 机械专硕299求调剂至材料 +3 kkcoco25 2026-03-16 4/200 2026-03-21 03:52 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕,总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见