24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2600  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

[交流] 系统树如何分析

大家好:
    测序是送CCTCC测得,16S rRNA序列。
    序列BLAST后搜到几十株同源性在92%以上的菌株,选取97%以上的10株左右,最高的99%同源性然后借助MEGA5.0,Neighbor-Joining Tree分析法构建系统发育树并通过Bootstrap method 1000,在最终获得发育树,见下图。但是不知道怎么分析,因为写文章不可能就把树摆上完了,我不会专业的分析。求教专家的虫友帮忙分析一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

做好眼前的东西!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjs713

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+2 2014-10-03 23:07:54
分析分两部分进行,首先说一下 你的序列跟xxx  xxx的同源性分别为多少%,跟FZB42同源性为多少%,这是blast的结果,说明从中可以看出与FZB42是具有最高的序列同源性的。
其次,根据后续的系统进化分析 进一步验证了该结论,即你的序列与FZB42是在同一个枝上,因此可以推断你的这个菌跟FZB42的种属关系比较接近
勤奋、执着、专注,则无坚不破。
7楼2014-10-03 19:07:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

xuerongtao

银虫 (小有名气)

就是这个树
系统树如何分析
AXER0OHOWU43S@KWHFXJ4W2.jpg

做好眼前的东西!
2楼2014-10-02 10:01:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lcat

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+1 2014-10-03 08:11:17
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。
5楼2014-10-02 22:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lcat at 2014-10-02 22:46:58
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。

我的菌是HP60,是和FZB42是一个种,但是呀你也知道要投高含量的文章,树的分析这块必须一针见血,说服审稿人的思想,说一句与FZB42一个种肯定是不行的
做好眼前的东西!
6楼2014-10-03 08:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 326求调剂 +5 Shansyn 2026-04-10 5/250 2026-04-10 22:23 by 猪会飞
[考研] 调剂 +19 小张ZA 2026-04-10 20/1000 2026-04-10 22:08 by 猪会飞
[考研] 材料工程日语考生求调剂 +5 0856?调剂 2026-04-10 5/250 2026-04-10 20:45 by yukihao
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 材料复试求调剂 +20 xhhdjdjsjks 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 10:25 by 孙小小12457
[考研] +6 化工专硕323分 2026-04-04 6/300 2026-04-10 10:04 by may_新宇
[考研] 材料与化工371求调剂 +17 陪琳看海 2026-04-04 18/900 2026-04-10 07:51 by 314126402
[考研] 278求调剂 +27 范婷娜 2026-04-07 31/1550 2026-04-09 20:49 by zhouxiaoyu
[考研] 计算机11408,286分求调剂 +9 木子念晞 2026-04-05 9/450 2026-04-09 20:04 by vgtyfty
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 280求调剂 +5 兮兮夜夜 2026-04-09 8/400 2026-04-09 11:15 by 兮兮夜夜
[考研] 070300化学279求调剂 +17 哈哈哈^_^ 2026-04-08 18/900 2026-04-09 10:49 by 三七七想上岸
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +17 熊二想上岸 2026-04-04 18/900 2026-04-09 09:13 by leyan1127
[考研] 一志愿郑州大学085600求调剂 +21 吃的不少 2026-04-05 24/1200 2026-04-08 16:47 by sunhuadong
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 农学,求调剂,314分 +4 访客记录可爱 2026-04-04 4/200 2026-04-07 21:07 by 等岸
[考研] 295求调剂 +18 xndjjj 2026-04-04 19/950 2026-04-07 11:02 by wangjy2002
[考研] 277求调剂 +5 考研调剂lxh 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:03 by chy09050039
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见