24小时热门版块排行榜    

查看: 2969  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

[交流] 系统树如何分析

大家好:
    测序是送CCTCC测得,16S rRNA序列。
    序列BLAST后搜到几十株同源性在92%以上的菌株,选取97%以上的10株左右,最高的99%同源性然后借助MEGA5.0,Neighbor-Joining Tree分析法构建系统发育树并通过Bootstrap method 1000,在最终获得发育树,见下图。但是不知道怎么分析,因为写文章不可能就把树摆上完了,我不会专业的分析。求教专家的虫友帮忙分析一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

做好眼前的东西!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuerongtao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lcat at 2014-10-02 22:46:58
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。

我的菌是HP60,是和FZB42是一个种,但是呀你也知道要投高含量的文章,树的分析这块必须一针见血,说服审稿人的思想,说一句与FZB42一个种肯定是不行的
做好眼前的东西!
6楼2014-10-03 08:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

xuerongtao

银虫 (小有名气)

就是这个树
系统树如何分析
AXER0OHOWU43S@KWHFXJ4W2.jpg

做好眼前的东西!
2楼2014-10-02 10:01:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lcat

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+1 2014-10-03 08:11:17
我觉得也没什么很多要说的吧,就是跟amyloli这个最接近,基本确定自己的菌株是这个种。
5楼2014-10-02 22:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjs713

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xuerongtao: 金币+2 2014-10-03 23:07:54
分析分两部分进行,首先说一下 你的序列跟xxx  xxx的同源性分别为多少%,跟FZB42同源性为多少%,这是blast的结果,说明从中可以看出与FZB42是具有最高的序列同源性的。
其次,根据后续的系统进化分析 进一步验证了该结论,即你的序列与FZB42是在同一个枝上,因此可以推断你的这个菌跟FZB42的种属关系比较接近
勤奋、执着、专注,则无坚不破。
7楼2014-10-03 19:07:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来~9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见