24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1915  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

bettyshan

木虫 (正式写手)

梦幻biobrick

[求助] 批量序列比对分析已有2人参与

想同时比对几百个基因在某一个基因组中是否存在同源基因,如何实现?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

我们都是芸芸众生的小人物,相遇相知,都是幸福!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bettyshan

木虫 (正式写手)

梦幻biobrick

引用回帖:
8楼: Originally posted by liuderong at 2014-10-11 17:18:50
用本地blast是要下载所有链霉菌的蛋白序列的,NCBI里好像没有单独将链霉菌的蛋白整理出来,你可以下载所有细菌的蛋白,ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/bacteria/这个FTP里头,进去之后网页拉到下面一点 ...

非常感谢了,如果有什么高速下载方法就好了~~
我们都是芸芸众生的小人物,相遇相知,都是幸福!
10楼2014-10-13 09:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 感谢应助 2014-10-03 07:16:47
bettyshan: 金币+5, 有帮助 2014-10-06 15:29:02
你可以下载bioedit这个软件(google一下就有),用它的本地blast功能,可以同时做多个query序列。摸索一下就行。
2楼2014-10-02 22:49:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bettyshan

木虫 (正式写手)

梦幻biobrick

引用回帖:
2楼: Originally posted by lcat at 2014-10-02 22:49:06
你可以下载bioedit这个软件(google一下就有),用它的本地blast功能,可以同时做多个query序列。摸索一下就行。

可以做多个序列与一个相同的基因组比对吗?
我们都是芸芸众生的小人物,相遇相知,都是幸福!
3楼2014-10-04 16:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
bettyshan: 金币+5, 有帮助 2014-10-06 15:29:12
NCBI有local blast供下载,网上还有很多教程。本地blast的确非常合适解决你的问题

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-10-04 18:46:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见