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批量序列比对分析
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bettyshan
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批量序列比对分析
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想同时比对几百个基因在某一个基因组中是否存在同源基因,如何实现?
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1楼
2014-09-30 10:15:18
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bettyshan
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8楼
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Originally posted by
liuderong
at 2014-10-11 17:18:50
用本地blast是要下载所有链霉菌的蛋白序列的,NCBI里好像没有单独将链霉菌的蛋白整理出来,你可以下载所有细菌的蛋白,ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/bacteria/这个FTP里头,进去之后网页拉到下面一点 ...
非常感谢了,如果有什么高速下载方法就好了~~
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10楼
2014-10-13 09:24:46
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2014-10-03 07:16:47
bettyshan: 金币+5,
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2014-10-06 15:29:02
你可以下载bioedit这个软件(google一下就有),用它的本地blast功能,可以同时做多个query序列。摸索一下就行。
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2楼
2014-10-02 22:49:06
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bettyshan
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2楼
:
Originally posted by
lcat
at 2014-10-02 22:49:06
你可以下载bioedit这个软件(google一下就有),用它的本地blast功能,可以同时做多个query序列。摸索一下就行。
可以做多个序列与一个相同的基因组比对吗?
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3楼
2014-10-04 16:51:22
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liuderong
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2014-10-06 15:29:12
NCBI有local blast供下载,网上还有很多教程。本地blast的确非常合适解决你的问题
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼
2014-10-04 18:46:34
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