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一旺百旺

新虫 (著名写手)

[求助] 测序的时候测序要求的选项怎么选? 已有6人参与

测序要求有六个选项:
正向
反向
双向
单向
单向测通
双向测通
这六个选项都有什么区别呀,,,完全不懂,求教。。。。越详细越好。。。完全的菜鸟一个
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tbsjxy

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-13 22:50:44
楼主你好,我刚毕业,在测序公司做技术服务的。你首先要根据你的样品类型,如果你是PCR片段的话,一般是自己提供引物的,如果片段大小在800以内,如果没有特殊结构,正向反向都是可以测通的。
如果你是菌液或质粒的话,公司一般会有载体上的通用引物的,也是根据你的片段大小来的,你的插入片段比较小的话只要一个方向就基本能测通,如果在800-1500基本是2个方向也可以测通的,如果您的片段更大的话,你要求双向测通,这时候公司会在测过两个反应后给你设计引物继续测通的,设计的引物是要收合成费的。
该用户由于违规已被禁言一辈子
5楼2014-08-11 22:12:15
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bolysu

禁虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2014-08-11 20:15:05
本帖内容被屏蔽

2楼2014-08-11 17:59:21
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未婚

金虫 (正式写手)

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币-1, 屏蔽内容, 乱码 2014-08-13 22:49:38
本帖内容被屏蔽

3楼2014-08-11 20:13:01
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-13 22:50:06
如果你自己提供测序引物,就不存在这个问题了(测序引物决定了方向)。如果用公司的引物,则会有这个问题。就一般测序而言,测一个方向就够了。
如果你要测定目标片段不是很大(如500bp左右),不管是正向还是反向都可以全部读出了。所以选正向和反向没有本质区别。
如果你的目标DNA较大,而且需要全部测出序列,这时则可能需要正反方向同时测,以便把整个顺序都读出。
如果你做的是点突变或其他突变体,而突变位置又距离上下游插入点较远,则可以在突变位置附近合成一测序引物,便于测序。
4楼2014-08-11 21:13:56
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