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溶解曲线不好荧光定量pcr的数据就用不了吗?
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梦梦神
新虫
(初入文坛)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 218.3
帖子: 31
在线: 24.6小时
虫号: 1809876
注册: 2012-05-11
专业: 环境微生物学
[
求助
]
溶解曲线不好荧光定量pcr的数据就用不了吗?
已有6人参与
[/img]
以PCR产物纯化后为模板进行荧光定量PCR,目的基因nxrB,如图
1溶解曲线的这两个杂峰第一个是二聚体第二个是非特异性扩增是吗?
2我退火温度从55提高一直到这次的63度,引物浓度也减半了(到5uM)可二聚体还是存在,这种情况该怎么优化实验条件?
3引物序列是根据文献上应该说比较成熟了的来合成的,看到些帖子说是污染了,在不重提DNA前提下有哪些地方可以优化的呢?
4扩增曲线看还是可以的,但是不是溶解曲线不好数据就完全用不了啊?
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1楼
2014-08-06 10:30:01
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yangxy04
金虫
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虫号: 3371790
注册: 2014-08-18
专业: 生物大分子结构与功能
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流
2014-08-20 16:57:27
溶解曲线显示有非特异性扩增,由于SYBRGREEN法的特点,引物二聚体和非特异扩增的结果都会导致Ct值不可信。
建议题主不愿意更换引物可以从以下几点进行优化:
1、降低反应体系中的引物浓度。
2、采用三步法进行反应。
3、可以考虑更换PCR mix试试。
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12楼
2014-08-20 16:28:51
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