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tea_gl9871

铜虫 (正式写手)

[求助] 转录组测序数据验证问题 已有1人参与

做了转录组测序,也挑选了一些基因做定量验证了。我的问题是怎么把定量验证结果和测序数据做相关性分析,有高手给指点一下吗?具体怎么操作。急啊!
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tea_gl9871

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-07-22 17:22:37
转录组和定量之间的比较,有点类似于定量和western的比较,它们两两之间是没有绝对的对应关系的,只能看趋势,比如转录组中某个基因在A处理中比B处理中高,定量也是A处理中比B处理中高,那就是对应得上,绝对的量化 ...

有没有详细的方法啊?
3楼2014-07-25 20:29:09
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-22 18:14:57
转录组和定量之间的比较,有点类似于定量和western的比较,它们两两之间是没有绝对的对应关系的,只能看趋势,比如转录组中某个基因在A处理中比B处理中高,定量也是A处理中比B处理中高,那就是对应得上,绝对的量化比较是没有意义的,我也没看到过那篇文献讨论这种量化对比。
2楼2014-07-22 17:22:37
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阿昌学习

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-07-22 17:22:37
转录组和定量之间的比较,有点类似于定量和western的比较,它们两两之间是没有绝对的对应关系的,只能看趋势,比如转录组中某个基因在A处理中比B处理中高,定量也是A处理中比B处理中高,那就是对应得上,绝对的量化 ...

怎么用转录组测序所得到的序列设计引物进行验证啊,也就是做半定量PCR
4楼2015-01-12 20:31:13
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阿昌学习

新虫 (小有名气)

楼主,怎么根据转录组序列设计的验证引物啊,最近也想验证一下,但是不知道怎么做
5楼2015-01-12 20:34:30
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