| 查看: 3141 | 回复: 14 | ||
憨憨可爱多木虫 (正式写手)
|
[求助]
求转录组测序相关文章已有2人参与
|
|
|
想要做一种植物的转录组测序，但是它没有基因组测序也没有NCBI中也没有EST序列，这样的话后期分析有意义吗？ 求植物方面的转录组测序相关的代表文章，好参考参考 谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种?
已经有5人回复
-
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有162人回复
-
求助 食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社 电子版
已经有5人回复
-
胶体几丁质的结晶度？
已经有0人回复
-
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士
已经有2人回复
-
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
有关转录组测序的两个问题，谢谢！
已经有3人回复- 测序需要生物学重复！（转载）
已经有6人回复
- 转录组测序回来后。。。。。。。。。。
已经有3人回复
- 转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答
已经有5人回复
- 植物转录组测序结果
已经有9人回复
- 转录组测序投稿
已经有5人回复
- 急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因
已经有9人回复
- 转录组测序所需RNA提取
已经有14人回复
- 《求助》 转录组样品，混合与分开测序的区别？！！！
已经有13人回复
- 关于3' RACE 测序结果分析。
已经有4人回复
- 求助关于转录组
已经有12人回复
- 植物转录组测序
已经有19人回复
- 2011NSFC申请时写的用基因芯片，现在准备改成转录组测序，不知这样调整行不行？
已经有6人回复
- 转录组测序 可行性
已经有12人回复
- 求高人翻译关于水稻转录组测序的一段摘要
已经有1人回复
- 抗寒胁迫下，做转录组测序的取样部位问题。
已经有6人回复
- 关于转录组RNA-Seq分析
已经有17人回复
- 怎么进行转录组分析
已经有6人回复
- 转录组数据分析免费软件
已经有11人回复
- 转录组研究前沿
已经有21人回复
- 上海晶能转录组测序可靠吗？
已经有5人回复
- 【求助/交流】请教植物RNA提取和转录组学
已经有16人回复
- 【求助】关于潜热通量
已经有3人回复
观止矣
木虫 (小有名气)
蠹虫
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2894.4
- 红花: 2
- 帖子: 68
- 在线: 22.8小时
- 虫号: 1529730
- 注册: 2011-12-08
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-11-16 11:29:43
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-11-16 11:29:43
|
容不容易做其实无所谓，都是送出去。一般而言，无参考基因组的转录组，一般有几个步骤： 1）对原始数据进行去除接头序列及低质量reads的处理； 2）数据产出统计及测序数据的成分和质量评估； 3）组装结果分析； 4）Unigene功能注释及COG分析； 5）Unigene的GO分类； 6）Unigene代谢通路分析； 7）预测编码蛋白框（CDS）； 8）Unigene表达差异分析； 9）Unigene在样品间的差异GO分类和Pathway富集性分析； 10）SNP分析（仅针对真核生物）； 11）SSR开发及引物设计（仅针对真核生物）。 当然，最重要的RNA-seq肯定是做不了的，因为没有基因组信息。 多倍体转录组目前研究的人非常少，如果你打算做的话，可以做最基本的一些分析，也能发paper的，嘿嘿。 话说回来，不知道你的多倍体是自然加倍还是人工加倍，是同源还是异源，你可以多看一些文献，多倍体的转录翻译都与一般的二倍体存在很大差异。多看综述哦。 |
9楼2013-10-17 20:19:25
jasco
木虫 (正式写手)
- MolEPI: 1
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 1626.1
- 红花: 3
- 帖子: 991
- 在线: 82小时
- 虫号: 287776
- 注册: 2006-10-21
- 专业: 生物化学
6楼2013-10-16 13:49:26
观止矣
木虫 (小有名气)
蠹虫
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2894.4
- 红花: 2
- 帖子: 68
- 在线: 22.8小时
- 虫号: 1529730
- 注册: 2011-12-08
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
2楼2013-10-15 09:20:17
憨憨可爱多
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2554.3
- 散金: 16
- 红花: 1
- 帖子: 342
- 在线: 93小时
- 虫号: 1906119
- 注册: 2012-07-23
- 性别: GG
- 专业: 林木遗传育种学
3楼2013-10-15 15:03:30
4楼2013-10-16 09:13:06
憨憨可爱多
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2554.3
- 散金: 16
- 红花: 1
- 帖子: 342
- 在线: 93小时
- 虫号: 1906119
- 注册: 2012-07-23
- 性别: GG
- 专业: 林木遗传育种学
5楼2013-10-16 09:26:45
taccycle
铜虫 (小有名气)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 112.9
- 帖子: 60
- 在线: 19.5小时
- 虫号: 2364578
- 注册: 2013-03-21
- 性别: GG
- 专业: 遗传学研究新技术与方法
7楼2013-10-16 16:00:40
憨憨可爱多
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2554.3
- 散金: 16
- 红花: 1
- 帖子: 342
- 在线: 93小时
- 虫号: 1906119
- 注册: 2012-07-23
- 性别: GG
- 专业: 林木遗传育种学
8楼2013-10-16 16:01:41
憨憨可爱多
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2554.3
- 散金: 16
- 红花: 1
- 帖子: 342
- 在线: 93小时
- 虫号: 1906119
- 注册: 2012-07-23
- 性别: GG
- 专业: 林木遗传育种学
10楼2013-10-20 09:33:34