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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

[求助] 求转录组测序相关文章 已有2人参与

想要做一种植物的转录组测序，但是它没有基因组测序也没有NCBI中也没有EST序列，这样的话后期分析有意义吗？
求植物方面的转录组测序相关的代表文章，好参考参考
谢谢
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1楼 2013-10-14 11:12:32
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jasco

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 憨憨可爱多 at 2013-10-15 15:03:30
我是想做几种不同倍性的植物的转录组差异，筛选差异表达基因，这样没有参考基因容易不...

这个目的的话，做消减文库更直接
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6楼2013-10-16 13:49:26
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观止矣

木虫 (小有名气)

蠹虫
★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-10-15 10:41:55
可以选择无参考基因组的转录组，虽然可能不如有参考基因组的准确，但一般来说还是有一定意义的。你首先要设计好实验，不要盲目上手，一定选好对照和实验株系，做好重复，提取RNA要过关，测序深度要适当。总之就是比较费钱，哈哈。
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做人要知足，做事要知不足，做学问要不知足。
2楼2013-10-15 09:20:17
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 观止矣 at 2013-10-15 09:20:17
可以选择无参考基因组的转录组，虽然可能不如有参考基因组的准确，但一般来说还是有一定意义的。你首先要设计好实验，不要盲目上手，一定选好对照和实验株系，做好重复，提取RNA要过关，测序深度要适当。总之就是比 ...

我是想做几种不同倍性的植物的转录组差异，筛选差异表达基因，这样没有参考基因容易不
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3楼2013-10-15 15:03:30
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文库构建

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
构建细菌人工染色体文库（BAC文库），建好之后筛库就行了。
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4楼2013-10-16 09:13:06
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