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转录组测序回来后。。。。。。。。。。
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郭瑞坚001
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转录组测序回来后。。。。。。。。。。
我做的是昆虫转录组,拿到公司测序回来后,从转录组里筛选出我需要的基因序列,在Blast后发现后面列举的同源性(identity)较高的都是各种菌的。并且很多基因序列都是这种情况,这是怎么回事?求指导的同学帮忙解答一下,是不是我的昆虫体内的肠道微生物的基因也测出来了,混在昆虫的基因里面?并且哟很多基因都这样,我感觉微生物的应该不会占这么大比例啊?
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【求助/交流】为什么我反转录PCR的抗体的轻链基因测序后发现总是有终止子?
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1楼
2013-08-14 10:54:58
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cqzhang88
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你取的哪个部位的样本啊?
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生活大爆炸,找个朋友难。
2楼
2013-08-14 11:23:08
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2楼
:
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cqzhang88
at 2013-08-14 11:23:08
你取的哪个部位的样本啊?
我选取的整个虫子,用液氮研磨的
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2013-08-14 15:08:28
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郭瑞坚001: 金币+5
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3楼
:
Originally posted by
郭瑞坚001
at 2013-08-14 15:08:28
我选取的整个虫子,用液氮研磨的...
昆虫一般做blast就跟动物比,可能公司用的数据库比较大。
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4楼
2013-08-14 16:22:06
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