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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 转录组测序回来后。。。。。。。。。。
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郭瑞坚001

金虫 (小有名气)

[求助] 转录组测序回来后。。。。。。。。。。

我做的是昆虫转录组，拿到公司测序回来后，从转录组里筛选出我需要的基因序列，在Blast后发现后面列举的同源性（identity）较高的都是各种菌的。并且很多基因序列都是这种情况，这是怎么回事？求指导的同学帮忙解答一下，是不是我的昆虫体内的肠道微生物的基因也测出来了，混在昆虫的基因里面？并且哟很多基因都这样，我感觉微生物的应该不会占这么大比例啊？
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1楼2013-08-14 10:54:58
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郭瑞坚001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cqzhang88 at 2013-08-14 11:23:08
你取的哪个部位的样本啊？

我选取的整个虫子，用液氮研磨的
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3楼2013-08-14 15:08:28
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cqzhang88

木虫 (小有名气)

低调兔子

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你取的哪个部位的样本啊？

[ 发自小木虫客户端 ]
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生活大爆炸，找个朋友难。
2楼2013-08-14 11:23:08
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cqzhang88

木虫 (小有名气)

低调兔子

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
郭瑞坚001: 金币+5 2013-09-12 11:36:23
引用回帖:
3楼: Originally posted by 郭瑞坚001 at 2013-08-14 15:08:28
我选取的整个虫子，用液氮研磨的...

昆虫一般做blast就跟动物比，可能公司用的数据库比较大。

[ 发自小木虫客户端 ]
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生活大爆炸，找个朋友难。
4楼2013-08-14 16:22:06
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