【答案】应助回帖

11楼2013-11-16 11:08:31

ouou900110

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

可以用De novo测序，后采取从头组装的方法对转录组进行拼接，我也看过类似你情况的做转录组的文章，后面你可以下一些与你测序的物种亲缘性较近的有参考基因组的或者EST序列的物种，下这些参考基因组或者EST序列进行后续的分析

12楼2014-01-16 11:08:45

hxxzhz

铜虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

你需要做生物信息方面的。首先确定差异基因，然后做GO分析和KEGG分析。还有各种分析出来的数据，火山图，箱线图，散点图，等等。最后挑选出你需要的基因。我也是刚入门，共同学习。

努力做一件事情。。。

13楼2015-01-02 18:10:47

Ivy尘

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引用回帖:

9楼: Originally posted by 观止矣 at 2013-10-17 20:19:25
容不容易做其实无所谓，都是送出去。一般而言，无参考基因组的转录组，一般有几个步骤：
1）对原始数据进行去除接头序列及低质量reads的处理；
2）数据产出统计及测序数据的成分和质量评估；
3）组装结果分析； ...

无基因组背景和EST数据的植物进行转录组测序，可以通过与其他植物已经发表的基因序列比对初步注释一些片段、进行功能基因的研究么？求教！

14楼2015-02-03 19:48:08

街角拽幸福

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此时不奋斗更待何时

15楼2015-07-13 19:46:32