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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

[求助] 求转录组测序相关文章 已有2人参与

想要做一种植物的转录组测序,但是它没有基因组测序也没有NCBI中也没有EST序列,这样的话后期分析有意义吗?
求植物方面的转录组测序相关的代表文章,好参考参考
谢谢
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jasco at 2013-10-16 13:49:26
这个目的的话,做消减文库更直接...

谢谢
8楼2013-10-16 16:01:41
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查看全部 15 个回答

观止矣

木虫 (小有名气)

蠹虫

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-10-15 10:41:55
可以选择无参考基因组的转录组,虽然可能不如有参考基因组的准确,但一般来说还是有一定意义的。你首先要设计好实验,不要盲目上手,一定选好对照和实验株系,做好重复,提取RNA要过关,测序深度要适当。总之就是比较费钱,哈哈。
做人要知足,做事要知不足,做学问要不知足。
2楼2013-10-15 09:20:17
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 观止矣 at 2013-10-15 09:20:17
可以选择无参考基因组的转录组,虽然可能不如有参考基因组的准确,但一般来说还是有一定意义的。你首先要设计好实验,不要盲目上手,一定选好对照和实验株系,做好重复,提取RNA要过关,测序深度要适当。总之就是比 ...

我是想做几种不同倍性的植物的转录组差异,筛选差异表达基因,这样没有参考基因容易不
3楼2013-10-15 15:03:30
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文库构建

铁虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
构建细菌人工染色体文库(BAC文库),建好之后筛库就行了。
4楼2013-10-16 09:13:06
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