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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 公司给的转录组测序结果。这两个contig结果可以相加吗？
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戴胜鸟的爱

新虫 (初入文坛)

[求助] 公司给的转录组测序结果。这两个contig结果可以相加吗？ 已有1人参与

公司给的转录组测序结果。congtig结果表中，一个是nucleic acid 另一个是protein，这两个有啥区别吗，是不是contig的总数就等于这两个相加。

公司给的转录组测序结果。这两个contig结果可以相加吗？
nucleic acid.jpg


公司给的转录组测序结果。这两个contig结果可以相加吗？-1
protein.jpg
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1楼 2014-04-27 15:42:43
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unigene

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
戴胜鸟的爱: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-04-29 12:32:58
不是这个样子的哈，nucleotide与protein是不同的数据库注释的结果，也就是分别注释的结果，所以不能相加的哈！有问题可以给我发邮件哈，unigene@126.com
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2楼2014-04-28 13:13:49
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戴胜鸟的爱

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by unigene at 2014-04-28 13:13:49
不是这个样子的哈，nucleotide与protein是不同的数据库注释的结果，也就是分别注释的结果，所以不能相加的哈！有问题可以给我发邮件哈，unigene126.com

这是我看的一篇文章中的描述，它竟然把两个相加了，大部分文章中直接说blastx是不是只是通过protein库进行比较？谢谢指教
公司给的转录组测序结果。这两个contig结果可以相加吗？-2
文章中的描述.jpg
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3楼2014-04-29 13:04:10
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unigene

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
戴胜鸟的爱: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2014-04-30 08:49:05
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-30 10:40:41
一般只是与nr数据库进行比较就OK了，nr数据库是非冗余的蛋白数据库，这样结果比较真实可信哈。nt数据库有很多的冗余信息，结果可靠性太差。
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4楼2014-04-29 13:46:42
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戴胜鸟的爱

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by unigene at 2014-04-29 13:46:42
一般只是与nr数据库进行比较就OK了，nr数据库是非冗余的蛋白数据库，这样结果比较真实可信哈。nt数据库有很多的冗余信息，结果可靠性太差。

我看了一下，真如你那么说的，非常感谢，谢谢你
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5楼2014-04-30 08:49:06
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