24小时热门版块排行榜    

查看: 5025  |  回复: 3

zq347597638

新虫 (小有名气)

[求助] 关于转录组测序Unigene

想做基因差异表达,但是我们没有参考序列,只能做转录组测序,但是分析结果里面是4)Unigene功能注释及COG分析;

5)Unigene的GO分类;

6)Unigene代谢通路分析;

7)预测编码蛋白框(CDS);

8)Unigene表达差异分析;
这个Unigene到底指什么意思啊?  得出来的结果可靠吗?  请高手帮忙!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Dionysius

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-17 23:10:52
转录组测序的原始测序包含了很多的reads,通过序列的拼接,具有重叠区的reads会被组装成更大的片段,称之为contig。将reads比对回Contig,通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离,将这些Contig连在一起,最后得到两端不能再延长的序列,称之为Unigene。
转录组数据是比较可靠的,但是对筛选出的单个基因的功能进行验证的时候,最好再有针对性的测序验证。
Stop fighting,let it flow.
2楼2013-06-17 21:35:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zq347597638

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by niil at 2013-06-17 21:35:10
转录组测序的原始测序包含了很多的reads,通过序列的拼接,具有重叠区的reads会被组装成更大的片段,称之为contig。将reads比对回Contig,通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间 ...

谢谢指教 很有帮助!
3楼2013-06-20 17:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luck_cc

金虫 (正式写手)

想问一下楼主,你上面列出来的这些,都是怎么分析得到的,能学习下吗?我也正急需要这些
认真目标,勇往直前
4楼2013-11-20 16:14:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zq347597638 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
信息提示
请填处理意见