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zq347597638

新虫 (小有名气)

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[求助] 关于转录组测序Unigene

想做基因差异表达，但是我们没有参考序列，只能做转录组测序，但是分析结果里面是4）Unigene功能注释及COG分析；

5）Unigene的GO分类；

6）Unigene代谢通路分析；

7）预测编码蛋白框（CDS）；

8）Unigene表达差异分析；
这个Unigene到底指什么意思啊？得出来的结果可靠吗？请高手帮忙！

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1楼 2013-06-17 09:20:26

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niil

金虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-17 23:10:52

转录组测序的原始测序包含了很多的reads，通过序列的拼接，具有重叠区的reads会被组装成更大的片段，称之为contig。将reads比对回Contig，通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离，将这些Contig连在一起,最后得到两端不能再延长的序列，称之为Unigene。
转录组数据是比较可靠的，但是对筛选出的单个基因的功能进行验证的时候，最好再有针对性的测序验证。

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Stop fighting,let it flow.

2楼2013-06-17 21:35:10

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引用回帖:

2楼: Originally posted by niil at 2013-06-17 21:35:10
转录组测序的原始测序包含了很多的reads，通过序列的拼接，具有重叠区的reads会被组装成更大的片段，称之为contig。将reads比对回Contig，通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间 ...

谢谢指教很有帮助！

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3楼2013-06-20 17:25:43

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