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zq347597638

新虫 (小有名气)

[求助] 关于转录组测序Unigene

想做基因差异表达,但是我们没有参考序列,只能做转录组测序,但是分析结果里面是4)Unigene功能注释及COG分析;

5)Unigene的GO分类;

6)Unigene代谢通路分析;

7)预测编码蛋白框(CDS);

8)Unigene表达差异分析;
这个Unigene到底指什么意思啊?  得出来的结果可靠吗?  请高手帮忙!
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niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-17 23:10:52
转录组测序的原始测序包含了很多的reads,通过序列的拼接,具有重叠区的reads会被组装成更大的片段,称之为contig。将reads比对回Contig,通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离,将这些Contig连在一起,最后得到两端不能再延长的序列,称之为Unigene。
转录组数据是比较可靠的,但是对筛选出的单个基因的功能进行验证的时候,最好再有针对性的测序验证。
Stop fighting,let it flow.
2楼2013-06-17 21:35:10
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zq347597638

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by niil at 2013-06-17 21:35:10
转录组测序的原始测序包含了很多的reads,通过序列的拼接,具有重叠区的reads会被组装成更大的片段,称之为contig。将reads比对回Contig,通过paired-end reads能确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间 ...

谢谢指教 很有帮助!
3楼2013-06-20 17:25:43
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luck_cc

金虫 (正式写手)

想问一下楼主,你上面列出来的这些,都是怎么分析得到的,能学习下吗?我也正急需要这些
认真目标,勇往直前
4楼2013-11-20 16:14:13
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