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yan_807

新虫 (初入文坛)

[求助] 转录组基因克隆求助！！！急急急！！！

前段时间我们实验室进行了转录组测序，两个品种，一个耐盐一个相对不耐，测序后准备寻找差异基因。测序结果是公司进行组装并比对的，他们给我们找出了一些具有表达差异的基因，并且有对应的序列，这些序列我在NCBI上blast过，几乎都能和其他的物种比对上。然后我根据他们给出的序列设计引物，奇怪的是不论是这序列的全长还是只是一个片段都不能扩增出来，这是为什么呢？之前我请教过可能是公司拼接的问题，但除了拼接问题外还有没有其他可能性呢？而且如果是拼接问题，为什么又能跟其他物种比对上呢？求解求解求解。
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1楼2014-07-17 12:38:15
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海棠依旧磊

新虫 (初入文坛)
同求啊      我也是遇到同样的问题了   设计的2000bp的引物P不出目的条带
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2楼2014-07-19 19:32:33
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yan_807

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 海棠依旧磊 at 2014-07-19 19:32:33
同求啊      我也是遇到同样的问题了   设计的2000bp的引物P不出目的条带

经过后来多方验证，初步证明可能是公司拼接出了问题，不知道你那个是不是
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3楼2014-08-20 10:31:14
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an0ta

铜虫 (小有名气)
让公司重新拼接他们还会收费用么？我感觉我的数据也有问题~~
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责任感！
4楼2015-01-22 20:10:56
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