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yan_807

新虫 (初入文坛)

[求助] 转录组基因克隆求助!!!急急急!!!

前段时间我们实验室进行了转录组测序,两个品种,一个耐盐一个相对不耐,测序后准备寻找差异基因。测序结果是公司进行组装并比对的,他们给我们找出了一些具有表达差异的基因,并且有对应的序列,这些序列我在NCBI上blast过,几乎都能和其他的物种比对上。然后我根据他们给出的序列设计引物,奇怪的是不论是这序列的全长还是只是一个片段都不能扩增出来,这是为什么呢?之前我请教过可能是公司拼接的问题,但除了拼接问题外还有没有其他可能性呢?而且如果是拼接问题,为什么又能跟其他物种比对上呢?求解求解求解。
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yan_807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 海棠依旧磊 at 2014-07-19 19:32:33
同求啊      我也是遇到同样的问题了   设计的2000bp的引物P不出目的条带

经过后来多方验证,初步证明可能是公司拼接出了问题,不知道你那个是不是
3楼2014-08-20 10:31:14
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海棠依旧磊

新虫 (初入文坛)

同求啊      我也是遇到同样的问题了   设计的2000bp的引物P不出目的条带
2楼2014-07-19 19:32:33
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an0ta

铜虫 (小有名气)

让公司重新拼接他们还会收费用么?我感觉我的数据也有问题~~
责任感!
4楼2015-01-22 20:10:56
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