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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wyysunshine

木虫 (知名作家)

[求助] 求助:AT含量高的序列如何PCR? 已有1人参与

最近跑了一个序列,约750 bp。
降落PCR:1. 94度4 min;2. 94度30 s,3. 62度30 s,-1度/cycle,4. 63度1 min,5. go to 2,12次;6. 94度30 s,7. 57度30 s,8. 63度1 min,9. go to 6,24次;10. 63度10 min;11. 12度保存。
之后又试了不同的延伸温度,68啦,65啦,60啦都试过,可还是跑出来引物二聚体很多,带没有,就少数几个跑出来了。
把跑出来的几个进行回收测序,发现是我要的目的条带,但就是AT含量高达70%,请教下大家,AT含量高就很不好PCR吗?这个引物是自己根据现有的序列设计的,也不知道好不好,但通过Blast比对显示跟大多数植物是可以跑的出来的。PS,我这个是跑的它的一个内含子。谢谢各位大神支支招吧!3Q
小博士叩谢大家!!!

求助:AT含量高的序列如何PCR?
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顺其自然~~
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-22 08:39:13
低GC比例的序列很用以PCR,你的阳性样品不是有目的带吗?
样品里没有目的模板自然就P不出来。
2楼2014-07-21 17:34:41
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