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zhaoxinrui0511

金虫 (小有名气)

[求助] 如何获得含有内含子基因的完整cDNA序列? 已有4人参与

我要扩增的是一个黑曲霉基因(含有两段内含子)的cDNA序列,基因结构是这样的:
1-186是外显子(186 bp)
187-232是内含子
233-313是外显子(81 bp)
314-362是内含子
363-1583是外显子(1221 bp)
之前尝试了分别用PCR扩增三段外显子,再用融合PCR的方法连接,但由于前两个外显子片段太短而失败了,
请问有其他什么好办法吗?
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lone007

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 这是马甲 at 2014-06-22 09:56:42
含内含子的cDNA~~~

类似于说怀孕的男人这种赶脚
做一个合格的普通人
5楼2014-06-22 11:58:23
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lone007

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-06-22 11:32:34
zhaoxinrui0511: 金币+2, ★★★很有帮助, 不好意思,可能是我没表述清楚,我需要的是没有内含子的基因序列,除了RT之外,还有其他的方法吗 2014-06-22 16:08:03
cDNA的定义是:以成熟mRNA为模板在逆转录酶的作用下合成DNA单链,之后在DNA聚合酶的作用下合成的双链DNA。成熟的mRNA是不含有内含子的,因此,cDNA可以视为是基因组全部外显子的集合,无论你怎么扩都不会包含内含子。
做一个合格的普通人
2楼2014-06-22 08:42:49
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这是马甲

至尊木虫 (著名写手)

谁的马甲都不是

含内含子的cDNA~~~
这是一只什么都不懂的马甲~~~
4楼2014-06-22 09:56:42
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cm8002

金虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-15 21:41:54
就按照你之前融合PCR的作法 第一段可以用引物扩出来 第二段合成两条长引物相互退火延伸就行 再将前两段先融合 最后剩下的就好办了吧 但是这样步骤比较多 费事 要是有钱干脆买个反转录试剂盒

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14楼2014-06-23 00:30:39
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普通回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhaoxinrui0511(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-22 12:30:23
zhaoxinrui0511: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-06-22 16:03:48
扩增cDNA要提RNA,逆转录后的产物做模版。要是嫌麻烦,就叫核酸合成公司合成吧,很快的。
3楼2014-06-22 09:35:36
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhaoxinrui0511(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-22 12:30:43
zhaoxinrui0511: 金币+1, 有帮助 2014-06-22 16:06:42
搞不懂你到底要不要内含子。不要内含子直接用mRNA做RT,如果要内含子直接从基因组DNA中PCR。
6楼2014-06-22 12:23:29
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曾文正公

金虫 (著名写手)

不是很懂楼主的意思  不过如果楼主是需要全基因组序列的话  genebank里面有的
只有非常努力,才能看起来毫不费力
7楼2014-06-22 13:49:16
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zhaoxinrui0511

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-06-22 12:23:29
搞不懂你到底要不要内含子。不要内含子直接用mRNA做RT,如果要内含子直接从基因组DNA中PCR。

我想要得到的是不含内含子的基因序列,除了RT之外还有其他的方法吗?
8楼2014-06-22 16:05:02
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zhaoxinrui0511

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 曾文正公 at 2014-06-22 13:49:16
不是很懂楼主的意思  不过如果楼主是需要全基因组序列的话  genebank里面有的

我是想在大肠杆菌里表达该基因,所以需要没有内含子的序列
9楼2014-06-22 16:06:12
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zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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zhaoxinrui0511: 金币+13, 有帮助, 1 2014-06-22 21:36:47
应用NCBI查找连续的mRNA(含内含子)、cDNA、蛋白序列
http://www.doc88.com/p-676405989477.html
10楼2014-06-22 16:30:39
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